部署和配置医疗保健数据解决方案中的 DICOM 数据转换
DICOM 数据转换使您能够使用成像数据引入管道并将医学数字成像和通信 (DICOM) 数据引入 Fabric OneLake。 在将医疗保健数据解决方案和医疗保健数据基础功能部署到 Fabric 工作区后，您可以设置此功能。
DICOM 数据转换是 Microsoft Fabric 中医疗保健数据解决方案下的一项可选功能。 您可以根据具体需求或应用场景灵活地决定是否使用它。
先决条件
在部署医疗保健数据基础中安装基础笔记本和管道。
部署 DICOM 成像示例数据，如部署示例数据中所述。
部署和配置 OMOP 转换管道（可选）。 有关详细指南，请参阅：
部署 DICOM 数据转换
您可以使用医疗保健数据解决方案：部署医疗保健数据基础中所述的设置模块，部署该功能和关联的示例数据。 或者，您也可以稍后使用部署示例数据中的步骤部署示例数据。 此功能使用 340ImagingStudies 示例数据集。
如果未使用设置模块部署该功能，而是希望改用功能磁贴，请按照以下步骤操作：
转到 Fabric 上的“医疗保健数据解决方案”主页。
选择“DICOM 数据转换”磁贴。
在“功能”页面上，选择部署到工作区。
完成部署可能需要几分钟时间。 部署过程中不要关闭选项卡或浏览器。 在等待期间，您可以在另一个选项卡中工作。
部署完成后，您可以在消息栏上看到一条通知。
从消息栏中选择管理功能，以转到功能管理页面。
在这里，您可以查看、配置和管理使用该功能部署的项目。
项目
该功能可在您的医疗保健数据解决方案环境中安装以下两个笔记本和数据管道：
| 项目 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
| healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion | 笔记本 | 使用医疗保健数据解决方案库中的 MetadataExtractionOrchestrator 模块从 DCM 文件中提取 DICOM 元数据。 然后，元数据将存储在 铜牌湖屋的 ImagingDicom delta 表中。 |
| healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion | 笔记本 | 使用医疗保健数据解决方案库中的 MetadataToFhirConvertor 模块转换铜牌增量表中的 DICOM 元数据。 转换过程涉及将元数据从 ImagingDicom 表转换为 FHIR R4.3 格式的 FHIR ImagingStudy 资源。 输出另存为 NDJSON 文件。 |
| healthcare#_msft_imaging_with_clinical_foundation_ingestion | 数据管道 | 按顺序运行以下笔记本，将临床 FHIR NDJSON 数据和成像 DICOM 数据摄取到铜牌湖屋中的增量表中，然后将数据展平到银牌湖屋： • msft_raw_process_movement：编排从 Ingest 文件夹到 Process 文件夹的文件 移动，并确保 Process 文件夹中存在所有文件名 。 • msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion：从摄取的 DICOM DCM 文件中提取元数据（DICOM 标记）。 • msft_imaging_dicom_fhir_conversion：将元数据转换为 NDJSON 格式的 ImagingStudy 的 FHIR 表示形式。 • msft_fhir_ndjson_bronze_ingestion：有助于将 FHIR 和 ImagingStudy NDJSON 数据摄取到铜牌湖屋内的增量表中。 • msft_bronze_silver_flatten：转换和展平铜版湖屋中的数据，并将数据摄取到银色湖屋中。 |
DICOM 数据转换笔记本使用运行关联的数据管道所需的预配置值进行部署。 某些配置参数继承自全局配置。 默认情况下，您不需要对笔记本配置文件进行任何更改。 如果需要，可以打开笔记本并查看配置。
成像示例数据
医疗保健数据解决方案随附的示例数据包括可用于运行 DICOM 数据转换管道的成像示例数据集。 您还可以探索数据转换以及在铜牌、银牌和金牌湖屋中的进度。 提供的成像示例数据可能没有临床意义，但它们在技术上是完整且全面的，可以演示解决方案的成像功能。 若要访问示例数据文件夹，请确保下载成像示例数据集 340ImagingStudies，如部署示例数据中所述。
在 Azure Health Data Services 中部署 DICOM API
重要提示
仅当您在 Azure Health Data Services 中使用 DICOM 服务时，才遵循此部署部分。
Azure Health Data Services 是一个基于云的解决方案，可帮助您收集、存储和分析来自不同来源和格式的健康状况数据。 它支持各种医疗保健标准，例如 DICOM。 DICOM 服务（Azure Health Data Services 的一部分）是一种基于云的解决方案，使医疗保健组织能够使用任何支持 DICOM Web 的系统或应用程序安全高效地存储、管理和交换医学成像数据。
医疗保健数据解决方案中的 DICOM 数据转换与 DICOM 服务本机集成。 如果您已经在使用 DICOM 服务，则还可以使用医疗保健数据解决方案中的成像分析功能。 通过此本机集成，无需在两个服务之间手动集成数据集。 您无需将 DICOM 文件复制或移动到 OneLake 摄取文件夹。 相反，您可以为 Azure Health Data Services DICOM 服务创建 Gen2 的 OneLake 快捷方式 Azure Data Lake Storage 。 要了解有关设置数据湖集成的更多信息，请参阅：
有关此摄取管道的更多信息，请转到 选项 2：与 DICOM 服务集成. Alternatively，您可以摄取存储在 Gen2 存储中的 Azure Data Lake Storage DICOM 文件，而无需使用 Azure Health Data Services DICOM 服务。