Descrição geral das transformações OMOP em soluções de dados de cuidados de saúde
O objetivo da implementação de qualquer modelo de dados comum é estabelecer a padronização e simplificar a estruturação, o armazenamento, a partilha, a troca e o uso de dados. Em soluções de dados de cuidados de saúde, pode usar as transformações OMOP para implementar o modelo de dados comum (CDM) da Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) no ambiente do lakehouse no Fabric. Esta implementação fornece aos investigadores da comunidade OMOP o acesso à escala expansiva do OneLake e às capacidades de IA da plataforma Fabric. A configuração permite a execução eficiente e fiável de análises padronizadas para estudos observacionais ao nível dos pacientes e da população.
Ao implementar o CDM do OMOP no Fabric usando pipelines pré-criados, pode usar os blocos de notas fornecidos para criar modelos estatísticos, realizar estudos de distribuição populacional e utilizar os relatórios do Power BI para comparar visualmente várias intervenções e os seus efeitos nos resultados dos pacientes. Estas capacidades analíticas permitem aos investigadores realizar análises comparativas, tais como avaliar procedimentos e exposições a medicamentos ou examinar correlações entre exposições a medicamentos e ocorrências de doenças. Para referência e orientação, a capacidade também fornece blocos de notas de amostra para estes cenários.
As transformações OMOP são uma capacidade opcional em soluções de dados de cuidados de saúde no Microsoft Fabric. Tem a flexibilidade de decidir se deseja ou não usá-la, dependendo das suas necessidades ou cenários específicos.
Para saber como implementar, configurar e usar a capacidade de transformações OMOP, consulte:
- Implementar e configurar transformações OMOP
- Utilizar transformações OMOP
- Utilizar os blocos de notas de exemplo de transformações OMOP
Depois de transformar os seus dados no modelo OMOP, também pode consultar e analisar os dados utilizando a capacidade Deteção e criação de coortes (pré-visualização) em soluções de dados de cuidados de saúde.
O que está incluído no CDM OMOP
As soluções de dados de cuidados de saúde no Microsoft Fabric implementam o OMOP Common Data Model versão v5.4 com foco no mapeamento de recursos clínicos Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) para tabelas correspondentes OMOP no Fabric. O esquema CDM completo OMOP com todas as suas tabelas é preenchido no lakehouse healthcare#_msft_gold_omop. No entanto, apenas as tabelas clínicas são mapeadas para os recursos FHIR.
As tabelas em Economia padronizada da saúde estão fora do âmbito e não são mapeadas para nenhum recurso FHIR. Não serão preenchidas após a execução dos pipelines de transformação do lakehouse healthcare#_msft_silver para o lakehouse healthcare#_msft_gold_omop.
Incluímos Vocabulários padronizados para mapear terminologias e códigos de recursos clínicos FHIR para conceitos padrão correspondentes OMOP no domínio clínico.
O Conjunto de dados Athena contém referências a vocabulários específicos do domínio.
Os vocabulários padrão incluídos na versão atual são SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) e RxNorm.
