使用醫療保健資料解決方案中的 OMOP 轉換樣本筆記本
注意
目前正在更新此內容。
本區段會顯示兩個觀察性醫療結果研究聯盟 (OMOP) 樣本情境。 這些情境會反映 OMOP 社群對病患群體中主要和次要藥物暴露進行的常見臨床研究調查。 從以最短時間實現價值的角度來看，它展示了您在 Fabric 工作區中可以用多快的速度視覺化分析結果。 在資料管線分別填充銀牌和金牌湖倉中的快速健康照護互通資源 (FHIR) 臨床資料後，您就可以透過執行樣本筆記本來實現此視覺化效果。
先決條件
在執行樣本筆記本 healthcare#_msft_omop_drug_exposure_era_sample 和 healthcare#_msft_omop_drug_exposure_insights_sample 之前，請確認符合以下要求：
驗證 OMOP 是否已建立並使用樣本資料填入資料庫。
如部署 OMOP 轉換中所述，在您的環境中部署和設定 OMOP 樣本資料。
檢閱樣本筆記本設定，如下文中所述：
範例案例
樣本情境旨在確定依照性別和年齡分層的病患同類群組，這些病患同類群組在服用同一主要藥物的特定時期內暴露於次要藥物。 過程包括下列步驟：
依性別和年齡對患病患群體進行分層。
至少確定一次病患群體在一年內服用的藥物 (例如，等向胰島素，人 70 UNT/ML/胰島素，常規型，人 30 單位)。
如果沒有足夠的資料，請改為考量為期五年的時間段。
找出同一患者群體在同一時期接觸的另一種藥物 (第二種藥物)。
繪出跨性別層次要藥物暴露的分佈。
產生記錄並將分佈視覺效果化為長條圖。
提示
樣本情境引用 OHDSI 藥物時代樣本指令碼和OMOP 藥物暴露查詢。 您可以檢閱這些資源，詳細了解 OMOP 社群發佈的類似範例。
樣本筆記本執行輸入
開發設計的主要目標是產生藥物時代記錄，由 OMOP 標準化的衍生表 drug_era 表示。 此表儲存計算的藥物時代，包含依照人員、藥物成分和持久性視窗分組的藥物暴露彙總資訊。 它代表假定暴露於特定活性成分的連續時期，與單一藥物暴露記錄不同。
表格包含下列資料行：
drug_era_id：每個藥物時代的唯一識別碼。person_id：引用接觸藥物人員的外部索引鍵，人員表中包含人口統計詳細資訊 。drug_concept_id：引用活性成分標準化概念識別碼的外部索引鍵。drug_era_start_date：藥物時代的開始日期，源自第一次藥物暴露。drug_era_end_date：藥物時代的結束日期，基於最後一次藥物暴露。drug_exposure_count：藥物時代的藥物總暴露數。gap_days：未由導致藥物時代之藥物暴露記錄涵蓋的天數。
為了產生藥物時代記錄，我們使用了以下 OMOP 標準化臨床表：
藥物暴露：此表包含藥物暴露資料，包括
drug_exposure_id、person_id、drug_concept_id、drug_exposure_start_date、drug_exposure_end_date，和days_supply。概念：此表儲存各種詞彙 (如 RxNorm) 中概念之間的階層式關係。 它包括
ancestor_concept_id(對較高階概念的引用) 和descendant_concept_id(對較低階概念的引用)，代表較廣泛到較狹隘的概念連接。概念：此表包含概念資料，包括
concept_id、concept_name、domain_id、vocabulary_id和concept_class_id。
樣本輸入參數
primary_drug=1596977 - insulinsecondary_drug=1308216 - lisinoprilyear=2022
範例筆記本輸出
執行這兩個樣本筆記本時，它們會產生一個長條圖，其中包含從衍生 OMOP 表格 omop.drug_era 中辨識出的病患群體跨性別和年齡層特定時間段次要藥物暴露分佈。 在此範例中，我們考量為期一年的時間段。
您可以使用分佈分析以下幾個層面：
- 依性別和年齡的暴露影響。
- 受影響族群的中位數分佈。
- 描述族群特徵的描述性統計。
要牢記的事項
若要測試自訂情境，請複製樣本筆記本。 不要直接更新筆記本。
視覺化筆記本使用以下您可以設定用來執行不同分析的參數：
primary_drug：要分析的主要藥物。secondary_drug：要分析的次要藥物。year：應該執行分析的年份。
多次執行藥物暴露時代筆記本，首先會刪除所有現有的 OMOP drug_era 記錄，然後根據最新 OMOP 資料重新建立記錄。