在醫療保健資料解決方案中部署和設定 DICOM 資料轉換
注意
目前正在更新此內容。
DICOM 資料轉換讓您能夠使用影像資料擷取管線,並將醫療數位影像傳輸協定 (DICOM) 資料引入 OneLake。 將醫療保健資料解決方案和醫療保健資料基礎功能部署到 Fabric 工作區後,就可以設定該功能。
DICOM 資料轉換是 Microsoft Fabric 中的醫療保健資料解決方案底下的一項選用功能。 您可以根據特定需求或情境靈活地決定是否使用它。
先決條件
在部署醫療保健資料基礎中安裝基礎筆記本和管線。
按照部署樣本資料中所述部署 DICOM 影像樣本資料。
部署、設定和執行 OMOP 轉換管線 (選用)。 如需詳細指引,請參閱:
部署 DICOM 資料轉換
您可以使用醫療保健資料解決方案:部署醫療保健資料基礎中介紹的設定模組來部署該功能和關聯的範例資料。 或者,您也可以稍後使用部署範例資料中的步驟部署範例資料。 此功能使用 340ImagingStudies 樣本資料集。
如果您沒有使用設定模組來部署此功能,而是希望使用功能面板,請按照以下步驟操作:
前往 Fabric 上的醫療保健資料解決方案首頁。
選取 DICOM 資料轉換圖格。
在功能頁面上,選擇部署到工作區。
部署可能需要幾分鐘才能完成。 部署過程中請勿關閉索引標籤或瀏覽器。 等待期間,您可以在另一個索引標籤中工作。
部署完成後,您可以在訊息欄上看到一則通知。
在訊息列中選擇管理能力,進入能力管理頁面。
在這裡,您可以查看、設定和管理使用該功能部署的成品。
成品
此功能會在您的醫療保健資料解決方案環境中安裝以下兩個筆記本和資料管線:
成品 | 類型 | Description |
---|---|---|
healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion | 筆記本 | 使用醫療保健資料解決方案庫中的 MetadataExtractionOrchestrator 模組從 DCM 檔案擷取 DICOM 中繼資料。 然後將中繼資料儲存在銅牌湖倉中的 dicomimagingmetastore 增量表中。 |
healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion | 筆記本 | 使用醫療保健資料解決方案庫中的 MetadataToFhirConvertor 模組轉換銅牌增量表中的 DICOM 中繼資料。 轉換過程涉及將中繼資料從 dicomimagingmetastore 表轉換為 FHIR R4.3 格式的 FHIR ImagingStudy 資源。 輸出將另存為 NDJSON 檔。 |
healthcare#_msft_imaging_with_clinical_foundation_ingestion | 資料準銷售案源 | 按順序執行以下筆記本,以將臨床 FHIR NDJSON 資料和 DICOM 資料影響擷取到青銅湖倉中的增量表中,然後將資料壓平合併到銀牌湖倉中: • healthcare#_msft_raw_process_movement:協調檔案從擷取 資料夾移動到處理 資料夾,並確認處理資料夾中存在所有檔名。 • healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion:從擷取的 DICOM DCM 檔案擷取中繼資料 (DICOM 標籤)。 • healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion:將中繼資料轉換為 NDJSON 格式的 ImagingStudy FHIR 展示。 • healthcare#_msft_fhir_ndjson_bronze_ingestion:輔助將 FHIR 和 ImagingStudy NDJSON 資料擷取到銅牌湖倉內的增量表中。 • healthcare#_msft_bronze_silver_flatten:轉換和壓平合併銅牌湖倉的資料,並將資料擷取到銀牌湖倉。 |
DICOM 資料轉換筆記本使用執行關聯資料管線所需的預設定值進行部署。 某些設定參數繼承自全域配置。 根據預設,不需要對筆記本設定檔進行任何變更。 如果需要,可以打開筆記本並檢閱設定。
影像樣本資料
醫療保健資料解決方案附帶的樣本資料包括可用於執行 DICOM 資料轉換管線的影像樣本資料集。 您還可以透過銅牌、銀牌和金牌湖倉探索資料轉換和進度。 提供的影像樣本資料可能沒有臨床意義,但它們在技術上完整且全面,可以示範解決方案的影像功能。 若要存取樣本資料資料夾,請務必如部署樣本資料中所述,下載影像樣本資料集 340ImagingStudies。
在 Azure 健康資料服務中 部署 DICOM API
重要
只有在使用 Azure 健康資料服務中的 DICOM 服務時,才遵循此部署部分。
Azure 健康資料服務是一種雲端式解決方案,可協助您收集、儲存和分析來自不同來源和格式的健康資料。 它支援各種醫療保健標準,例如 DICOM。 DICOM 服務 (Azure 健康資料服務的一部分) 是一種雲端式解決方案,使醫療保健組織能夠與任何支援 DICOM Web 的系統或應用程式安全且有效率地儲存、管理和交換醫學影像資料。
醫療保健資料解決方案中的 DICOM 資料轉換與 DICOM 服務具有原生整合。 如果您已使用 DICOM 服務,您也可以使用醫療保健資料解決方案中的影像分析功能。 這種原生整合消除在兩個服務之間手動整合資料集的需求。 整合基於提供到 Azure Data Lake Storage Gen2 Azure 健康資料服務 DICOM 服務的 OneLake 捷徑。 若要設定資料湖整合,請按照使用 Azure Data Lake Storage 部署 DICOM 服務中的步驟操作。 有關此擷取管線的詳細資訊,請移至選項 2:與 DICOM 服務的端到端整合。
設定 Azure Data Lake Storage 擷取
如果您希望從您的 Azure Data Lake Storage Gen2 儲存體位置使用 DICOM 檔案,請遵循此自備儲存體 (BYOS) 設定選項。 使用此選項,您就無需將 DICOM 檔案複製或移動到 OneLake 擷取資料夾。 您可以改為建立到 Data Lake Storage Gen2 的 OneLake 捷徑,並從其原始儲存體位置存取 DICOM 檔案。