在醫療保健資料解決方案中部署和設定 DICOM 資料轉換
DICOM 資料轉換讓您能夠使用影像資料擷取管線,並將醫療數位影像傳輸協定 (DICOM) 資料引入 OneLake。 將醫療保健資料解決方案和醫療保健資料基礎功能部署到 Fabric 工作區後,就可以設定該功能。
DICOM 資料轉換是 Microsoft Fabric 中的醫療保健資料解決方案底下的一項選用功能。 您可以根據特定需求或情境靈活地決定是否使用它。
先決條件
在部署醫療保健資料基礎中安裝基礎筆記本和管線。
按照部署樣本資料中所述部署 DICOM 影像樣本資料。
部署和配置 OMOP 轉換管道 (可選)。 如需詳細指引,請參閱:
部署 DICOM 資料轉換
您可以使用醫療保健資料解決方案:部署醫療保健資料基礎中介紹的設定模組來部署該功能和關聯的範例資料。 或者,您也可以稍後使用部署範例資料中的步驟部署範例資料。 此功能使用 340ImagingStudies 樣本資料集。
如果您沒有使用設定模組來部署此功能,而是希望使用功能面板,請按照以下步驟操作:
前往 Fabric 上的醫療保健資料解決方案首頁。
選取 DICOM 資料轉換圖格。
在功能頁面上,選擇部署到工作區。
部署可能需要幾分鐘才能完成。 部署過程中請勿關閉索引標籤或瀏覽器。 等待期間,您可以在另一個索引標籤中工作。
部署完成後,您可以在訊息欄上看到一則通知。
在訊息列中選擇管理能力,進入能力管理頁面。
在這裡,您可以查看、設定和管理使用該功能部署的成品。
成品
此功能會在您的醫療保健資料解決方案環境中安裝以下兩個筆記本和資料管線:
成品 | 類型 | Description |
---|---|---|
healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion | 筆記本 | 使用醫療保健資料解決方案庫中的 MetadataExtractionOrchestrator 模組從 DCM 檔案擷取 DICOM 中繼資料。 然後,元數據將存儲在 銅牌湖存放庫的 ImagingDicom delta 表中。 |
healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion | 筆記本 | 使用醫療保健資料解決方案庫中的 MetadataToFhirConvertor 模組轉換銅牌增量表中的 DICOM 中繼資料。 轉換過程涉及將元數據從 ImagingDicom 表轉換為 FHIR R4.3 格式的 FHIR ImagingStudy 資源。 輸出將另存為 NDJSON 檔。 |
healthcare#_msft_imaging_with_clinical_foundation_ingestion | 資料準銷售案源 | 按順序運行以下筆記本,將臨床 FHIR NDJSON 數據和成像 DICOM 數據攝取到銅牌湖存放庫中的增量表中,然後將數據展平到銀牌湖存放庫: • msft_raw_process_movement:編排從 Ingest 資料夾到 Process 資料夾的文件 移動,並確保 Process 資料夾中存在所有檔名 。 • msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion:從攝取的 DICOM DCM 檔中提取元數據 (DICOM 標記)。 • msft_imaging_dicom_fhir_conversion:將元數據轉換為 NDJSON 格式的 ImagingStudy 的 FHIR 表示形式。 • msft_fhir_ndjson_bronze_ingestion:有助於將 FHIR 和 ImagingStudy NDJSON 數據攝取到銅牌湖存放庫內的增量表中。 • msft_bronze_silver_flatten:轉換和展平銅版湖存放庫中的數據,並將數據攝取到銀色湖存放庫中。 |
DICOM 資料轉換筆記本使用執行關聯資料管線所需的預設定值進行部署。 某些設定參數繼承自全域配置。 根據預設,不需要對筆記本設定檔進行任何變更。 如果需要,可以打開筆記本並檢閱設定。
影像樣本資料
醫療保健資料解決方案附帶的樣本資料包括可用於執行 DICOM 資料轉換管線的影像樣本資料集。 您還可以透過銅牌、銀牌和金牌湖倉探索資料轉換和進度。 提供的影像樣本資料可能沒有臨床意義,但它們在技術上完整且全面,可以示範解決方案的影像功能。 若要存取樣本資料資料夾,請務必如部署樣本資料中所述,下載影像樣本資料集 340ImagingStudies。
在 Azure 健康資料服務中 部署 DICOM API
重要
只有在使用 Azure 健康資料服務中的 DICOM 服務時,才遵循此部署部分。
Azure 健康資料服務是一種雲端式解決方案,可協助您收集、儲存和分析來自不同來源和格式的健康資料。 它支援各種醫療保健標準,例如 DICOM。 DICOM 服務 (Azure 健康資料服務的一部分) 是一種雲端式解決方案,使醫療保健組織能夠與任何支援 DICOM Web 的系統或應用程式安全且有效率地儲存、管理和交換醫學影像資料。
醫療保健資料解決方案中的 DICOM 資料轉換與 DICOM 服務具有原生整合。 如果您已使用 DICOM 服務,您也可以使用醫療保健資料解決方案中的影像分析功能。 這種原生整合消除在兩個服務之間手動整合資料集的需求。 您無需將 DICOM 檔案複製或移動到 OneLake 攝取資料夾。 相反,您可以為 Azure Health Data Services DICOM 服務創建 Gen2 的 OneLake 快捷方式 Azure Data Lake Storage 。 要瞭解有關設置數據湖集成的更多資訊,請參閱:
有關此攝取管道的更多資訊,請轉到 選項 2:與 DICOM 服務集成. 或者,可以引入存儲在 Gen2 儲存中的 Azure Data Lake Storage DICOM 檔,而無需使用 Azure Health Data Services DICOM 服務。