医疗保健数据解决方案中的 OMOP 转换概述

实施任何 Common Data Model 的目标是建立标准化并简化数据的结构、存储、共享、交换和使用。 在医疗保健数据解决方案中,您可以使用 OMOP 转换在 Fabric 湖屋环境中部署观察性医疗结果伙伴关系 (OMOP) Common Data Model (CDM)。 通过此部署,OMOP 社区内的研究人员可以访问 OneLake 的扩展规模和 Fabric 平台的 AI 功能。 该设置能够高效可靠地对患者和群体级别观察性研究执行标准化分析。

通过使用预生成管道将 OMOP CDM 部署到 Fabric,您可以使用提供的笔记本来构建统计信息模型、进行群体分布研究,并利用 Power BI 报表直观地比较各种干预措施及其对患者治疗效果的影响。 这些分析功能使研究人员能够执行比较分析,例如评估手术和药物暴露或检查药物暴露与疾病发生之间的相关性。 作为参考和指导,该功能还提供了适用于这些应用场景的示例笔记本。

OMOP 转换是 Microsoft Fabric 中医疗保健数据解决方案下的一项可选功能。 您可以根据具体需求或应用场景灵活地决定是否使用它。

若要了解如何部署、配置和使用 OMOP 转换功能,请参阅:

将数据转换到 OMOP 模型中后,您还可以使用医疗保健数据解决方案中的发现和生成队列(预览版)功能查询和分析数据。

OMOP CDM 中包含的内容

Microsoft Fabric 中的医疗保健数据解决方案实施 OMOP Common Data Model 版本 v5.4,侧重于将快速医疗保健互操作性资源 (FHIR) 临床资源映射到 Fabric 中相应的 OMOP 表。 完整的 OMOP CDM 架构及其所有表都填充在 healthcare#_msft_gold_omop 湖屋中。 但是,仅临床表映射到 FHIR 资源。

  • 标准化健康经济学下的表超出范围,不会映射到任何 FHIR 资源。 在执行将管道从 healthcare#_msft_silver 湖屋转换到 healthcare#_msft_gold_omop 湖屋的操作后,它们不会填充。

  • 我们包括标准化词汇,以将 FHIR 临床资源中的术语和代码映射到临床领域中的相应 OMOP 标准概念。

    Athena 数据集包含对特定领域词汇的引用。

  • 当前版本中包含的标准词汇包括 SNOMED-CT(医学系统命名法 - 临床术语)、LOINC(观测指标标识符逻辑命名与编码系统)和 RxNorm

显示 OMOP Common Data Model 描述的图像。