Översikt över OMOP-omvandlingar i vårddatalösningar
Målet med att implementera en gemensam datamodell är att upprätta standardisering och effektivisera strukturering, lagring, delning, utbyte och användning av data. I vårddatalösningar kan du använda OMOP-omvandlingar för att distribuera Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) Common Data Model i Fabric sjöhusmiljön. Den här distributionen ger forskare inom OMOP-communityn tillgång till OneLakes expansiva skala och AI-funktionerna i Fabric-plattformen. Upplägget möjliggör effektiv och tillförlitlig körning av standardiserade analyser för observationsstudier på patient- och populationsnivå.
Genom att distribuera OMOP CDM till Fabric med hjälp av fördefinierade pipelines kan du använda de medföljande notebook-filer för att konstruera statistiska modeller, utföra populationsfördelningsstudier och använda Power BI-rapporter för att visuellt jämföra olika interventioner och deras effekter på patientresultat. Dessa analytiska förmågor gör det möjligt för forskare att utföra jämförande analyser, såsom att utvärdera procedurer och läkemedelsexponeringar eller undersöka korrelationer mellan läkemedelsexponering och sjukdomsförekomster. Som referens och vägledning innehåller funktionen även notebook-exempelfiler för dessa scenarier.
OMOP-omvandlingar är en valfri funktion under vårddatalösningar i Microsoft Fabric. Du har flexibiliteten att bestämma om du vill använda den eller inte, beroende på dina specifika behov eller scenarier.
För att lära dig hur du distribuerar, konfigurerar och använder OMOP omvandlingsfunktionen, se:
- Distribuera och konfigurera OMOP-omvandlingar
- Använd OMOP-omvandlingar
- Använda exempelnotebook-filer för OMOP-omvandlingar
När du har omvandlat dina data till OMOP-modellen kan du även fråga och analysera data med hjälp av funktionen Identifiera och skapa kohorter (förhandsversion) i vårddatalösningar.
Vad som ingår i OMOP CDM
Vårddatalösningar i Microsoft Fabric implementerar OMOP Common Data Model version v5.4 med fokus på att mappa kliniska FHIR-resurser (Fast Healthcare Interoperability Resources) till motsvarande OMOP-tabeller i Fabric. Det fullständiga OMOP CDM-schemat med alla dess tabeller fylls i i sjöhuset healthcare#_msft_gold_omop. Det är dock bara de kliniska tabellerna som mappas till FHIR-resurser.
Tabellerna under Standardiserad hälsoekonomi ligger utanför omfånget och mappas inte till några FHIR-resurser. De fylls inte i när omvandlingspipelines körs från sjöhuset healthcare#_msft_silver till sjöhuset healthcare#_msft_gold_omop.
Vi inkluderar standardiserade vokabulärer för att kartlägga terminologier och koder från FHIR:s kliniska resurser till motsvarande OMOP standardbegrepp inom den kliniska domänen.
Athena-datauppsättningen innehåller referenser till domänspecifika vokabulärer.
Standardvokabulärer som ingår i den aktuella utgåvan är SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) och RxNorm.
