Distribuera och konfigurera DICOM-dataomvandlingar i sjukvårdsdatalösningar
Med DICOM-dataomvandling kan du använda inmatningspipelinen för avbildningsdata och ta med din DICOM-data (Digital Imaging and Communications in Medicine) till OneLake. Du kan ställa in den här funktionen efter att du har distribuerat vårddatalösningar och funktionen vårddatagrunder till din Fabric-arbetsyta.
DICOM-dataomvandling av försäkringsdata (förhandsgranskning) är en valfri funktion under vårddatalösningar i Microsoft Fabric. Du har flexibiliteten att bestämma om du vill använda den eller inte, beroende på dina specifika behov eller scenarier.
Förutsättningar
Installera grundläggande notebook-filer och pipelines i Distribuera vårddatagrunder.
Distribuera exempeldata för DICOM-avbildning enligt beskrivningen i Distribuera exempeldata.
Distribuera och konfigurera omvandlingspipelinen OMOP (valfritt). Detaljerad vägledning finns i:
Distribuera DICOM dataomvandling
Du kan distribuera funktionen och associerade exempeldata med hjälp av installationsmodulen som beskrivs i Datalösningar för hälso- och sjukvård: Distribuera vårddatagrunder. Du kan också distribuera exempeldata senare med hjälp av stegen i Distribuera exempeldata. Den här funktionen använder exempeldatauppsättningen 340ImagingStudies.
Om du inte använde installationsmodulen för att distribuera funktionen och vill använda funktionspanelen i stället följer du dessa steg:
Gå till startsidan för vårddatalösningar på Fabric.
Välj panelen DICOM dataomvandling.
På funktionssidan väljer du Distribuera till arbetsyta.
Distribution kan ta några minuter att slutföra. Stäng inte fliken eller webbläsaren medan distributionen pågår. Medan du väntar kan du arbeta på en annan flik.
När distributionen är klar kan du se ett meddelande i meddelandefältet.
Välj Hantera funktion i meddelandefältet för att gå till sidan Kapacitetshantering.
Här kan du visa, konfigurera och hantera de artefakter som distribueras med funktionen.
Artefakter
Funktionen installerar följande två bärbara datorer och datapipeline i din miljö för vårddatalösningar:
| Artefakt | Type | Beskrivning |
|---|---|---|
| healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion | Notebook-fil | Använd modulen MetadataExtractionOrchestrator i biblioteket med vårddatalösningar för att extrahera DICOM-metadata från DCM-filer. Metadata lagras sedan i deltatabellen ImagingDicom i brons sjöhus. |
| healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion | Notebook-fil | Använder modulen MetadataToFhirConvertor i biblioteket för vårddatalösningar för att konvertera DICOM-metadata i bronsdeltatabellen dicomimagingmetastore. Konverteringsprocessen omfattar att transformera metadata från tabellen ImagingDicom till FHIR ImagingStudy-resursen i FHIR R4.3-format. Utdata sparas som NDJSON-filer. |
| healthcare#_msft_imaging_with_clinical_foundation_ingestion | Datapipeline | Kör sekventiellt följande notebook-filer för att mata in kliniska FHIR NDJSON-data och avbildande DICOM-data i deltatabeller i brons sjöhus och plattar sedan ut data till silver sjöhus: • msft_raw_process_movement: Orkestrerar filförflyttning från inmatningsmappen till processmappen och säkerställer att alla filnamn finns i processmappen . • msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion: Extraherar metadata (DICOM-taggar) från de inmatade DICOM DCM-filerna. • msft_imaging_dicom_fhir_conversion: Konverterar metadata till FHIR-representationen av ImagingStudy i NDJSON-format. • msft_fhir_ndjson_bronze_ingestion: Underlättar inmatningen av FHIR- och ImagingStudy NDJSON-data i deltatabeller i brons sjöhus. • msft_bronze_silver_flatten: Omvandlar och plattar ut data från brons sjöhus och matar in data till silver sjöhus. |
Notebook-filerna för DICOM-dataomvandling distribueras med förkonfigurerade värden som krävs för att köra den associerade datapipeline. Vissa konfigurationsparametrar ärver från den globala konfigurationen. Som standard behöver du inte göra några ändringar i notebook-konfigurationsfiler. Om det behövs kan du öppna notebook och granska konfigurationen.
Avbildar exempeldata
Exempeldata som levereras med vårddatalösningar innehåller exempeldatauppsättningarna för avbildning som du kan använda för att köra pipelinen för DICOM-dataomvandling. Du kan också utforska dataomvandling och förlopp genom brons-, silver- och guldsjöhusen av medaljongtyp. Medföljande exempeldata för avbildning kanske inte är kliniskt meningsfulla, men de är tekniskt kompletta och omfattande för att demonstrera lösningens avbildningskapacitet. Om du vill komma åt exempeldatamapparna måste du ladda ned exempeldatauppsättningen för avbildning 340ImagingStudies enligt beskrivningen i Distribuera exempeldata.
Distribuera DICOM API i Azure Health Data Services
Viktigt
Följ bara det här distributionsavsnittet om du använder DICOM-tjänsten i Azure Health Data Services.
Azure Health Data Services är en molnbaserad lösning som hjälper dig att samla in, lagra och analysera sjukvårdsdata från olika källor och format. Den stöder olika hälso- och sjukvårdsstandarder, till exempel DICOM. DICOM-tjänsten (ingår i Azure Health Data Services) är en molnbaserad lösning som gör det möjligt för vårdorganisationer att lagra, hantera och utbyta medicinsk bilddata säkert och effektivt med alla DICOM-webbaserade system eller appar.
DICOM-dataomvandling i vårddatalösningar har en inbyggd integrering med DICOM-tjänsten. Om du redan använder DICOM-tjänsten kan du också använda funktionerna för bildanalys i vårddatalösningar. Den här inbyggda integreringen eliminerar behovet av manuell integrering av datauppsättningar mellan de två tjänsterna. Du behöver inte kopiera eller flytta DICOM-filerna till OneLake-inmatningsmappar. I stället kan du skapa en OneLake-genväg till Azure Data Lake Storage Gen2 för DICOM-tjänsten Azure Health Data Services. Mer information om hur du konfigurerar Data Lake-integreringen finns i:
- Hantera medicinska bilddata med DICOM-tjänsten och Azure Data Lake Storage
- Distribuera DICOM-tjänsten med Azure Data Lake Storage.
Mer information om den här inmatningspipelinen finns i Alternativ 2: Integrering med DICOM-tjänsten. Du kan också mata in DICOM-filer som lagras i din Azure Data Lake Storage Gen2-lagring utan att använda Azure DICOM-tjänsten för hälsodatatjänster.