Udostępnij za pośrednictwem

Omówienie przekształcania danych DICOM w rozwiązaniach do obsługi danych medycznych

  • Artykuł

Możliwość przekształcania danych DICOM w rozwiązaniach do obsługi danych medycznych umożliwia pozyskiwanie własnych danych z zakresu obrazowania cyfrowego i komunikacji w medycynie (DICOM) do usługi OneLake programu Fabric. Możesz pozyskiwać, przechowywać i analizować metadane obrazowania z różnych modalności, takich jak zdjęcia rentgenowskie, tomografia komputerowa (CT) i rezonans magnetyczny (MRI). Ta funkcja umożliwia współpracę, badania i rozwój (R&D) oraz innowacje w zakresie sztucznej inteligencji w różnych przypadkach użycia w opiece zdrowotnej i naukach przyrodniczych. Integracja danych obrazowania z danymi klinicznymi przechowywanymi w formacie FHIR (Fast Health Interoperability Resources) umożliwia klinicystom i badaczom interpretowanie wyników obrazowania we właściwym kontekście klinicznym. Ta interpretacja prowadzi do większej dokładności diagnostycznej, pouczających decyzji klinicznych i lepszych wyników leczenia pacjentów.

Potoki rozwiązań danych opieki zdrowotnej umożliwiają bezproblemową transformację danych DICOM (obrazowania) do formatów tabelarycznych, które mogą być utrwalane w magazynie lakehouse w formatach FHIR (srebrny) i OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) (złoty). Ułatwiają one przeprowadzanie analiz eksploracyjnych oraz przeprowadzanie wielkoskalowych analiz obrazowych i radiomiki. Proces transformacji danych za pośrednictwem potoku pozyskiwania obrazowania składa się z następujących etapów:

  1. Potok pobiera i utrwala nieprzetworzone pliki obrazowania DICOM, obecne w natywnym formacie DCM, w brązowego magazynu lakehouse.
  2. Następnie wyodrębnia metadane DICOM (znaczniki) z plików obrazowania i wstawia je do magazynu metadanych DICOM DICOM z brązowego magazynu lakehouse w celu prostego wykonywania zapytań.
  3. Dane w magazynie metadanych DICOM są konwertowane na pliki NDJSON tabeli delta FHIR ImagingStudy, przechowywane w usłudze OneLake i przekształcane do relacyjnego formatu FHIR (srebrny magazyn lakehouse).
  4. Na koniec dane są przekształcane do tabeli delta Image_Occurrence w formacie OMOP (złoty magazyn lakehouse).

Ta transformacja ułatwia realizację scenariuszy, takich jak:

  • Udostępnianie zbiorów danych badawczych z kontrolą dostępu opartą na rolach.
  • Usuwanie elementów pozwalających na identyfikację danych tekstowych i obrazowych na potrzeby badań i współpracy.
  • Używanie danych DICOM do trenowania i weryfikowania modeli uczenia maszynowego.
  • Wykorzystanie danych DICOM do prowadzenia badań klinicznych, analiz epidemiologicznych i działań edukacyjnych.

Przekształcanie danych DICOM jest opcjonalną możliwością w rozwiązaniach do obsługi danych medycznych w Microsoft Fabric. Masz swobodę decydowania, czy chcesz go używać, w zależności od konkretnych potrzeb lub scenariuszy.

Aby zapoznać się z tą funkcją i dowiedzieć się więcej o wdrażaniu, konfiguracji i użyciu, zobacz:

Architektura koncepcyjna

Jak wyjaśniono w temacie Architektura danych i zarządzanie w rozwiązaniach do obsługi danych medycznych, podstawą tej funkcji jest architektura magazynu lakehouse medalionu. Oto jak ta struktura organizuje i przetwarza dane DICOM w trzech warstwach magazynu lakehouse:

  • Brązowy: ta pierwsza warstwa przechowuje źródłowe dane obrazowania w oryginalnym formacie DICOM (pliki DCM) oraz w magazynie metadanych zawierającym pełny zestaw metadanych (znaczników DICOM) wyodrębnionych z plików DCM.

  • Srebrny: warstwa srebrna (na podstawie specyfikacji FHIR) przechowuje metadane obrazowania pochodzące z brązowego magazynu lakehouse. Przechowywane są również łącza plików referencyjnych do lokalizacji plików programu DCM w warstwie brązowej. Metadane obrazowania i odwołania do plików są przechowywane w tabeli delta ImagingStudy, której schemat jest oparty na spłaszczonym formacie zasobu ImagingStudy FHIR (R4.3).

  • Złoto: Złoty warstwa (w oparciu o OMOP specyfikację) przechowuje i przekształca dane obrazowania pochodzące z srebrnej tabeli delta magazyn lakehouse ImagingStudy . Metadane obrazowania i odniesienia do plików są przechowywane w tabeli delta złota Image_Occurrence, której schemat jest oparty na najnowszych osiągnięciach standaryzacji danych dla badań obserwacyjnych opartych na obrazowaniu. Aby uzyskać więcej informacji na temat tej standaryzacji, zobacz OMOP Common Data Model Extension dla danych obrazowania medycznego.

Aby dowiedzieć się, w jaki sposób metadane DICOM przekształcają się w różnych magazynach lakehouse, i zapoznać się z mapowaniem transformacji, zobacz Mapowanie transformacji metadanych DICOM w rozwiązaniach danych opieki zdrowotnej.