Overzicht van OMOP-transformaties in oplossingen voor gezondheiszorggegevens
Het doel van de implementatie van een gemeenschappelijk gegevensmodel is het bereiken van standaardisatie en het stroomlijnen van de structurering, opslag, het delen, de uitwisseling en het gebruik van gegevens. In oplossingen voor gezondheidszorggegevens kunt u OMOP-transformaties gebruiken om het Common Data Model (CDM) van Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) te implementeren in de Fabric lakehouse-omgeving. Dankzij deze implementatie krijgen onderzoekers binnen de OMOP-community toegang tot de enorme schaal van OneLake en de AI-mogelijkheden van het Fabric-platform. De opstelling maakt een efficiënte en betrouwbare uitvoering van gestandaardiseerde analyses voor observationele onderzoeken op patiënt- en populatieniveau mogelijk.
Door het OMOP CDM te implementeren in Fabric met behulp van vooraf gebouwde pipelines, kunt u de meegeleverde notitieblokken gebruiken om statistische modellen te maken, onderzoeken naar de verspreiding van de populatie uit te voeren en Power BI-rapporten te gebruiken om verschillende interventies en hun effecten op patiëntresultaten visueel te vergelijken. Dankzij deze analytische mogelijkheden kunnen onderzoekers vergelijkende analyses uitvoeren, zoals het evalueren van procedures en blootstelling aan medicijnen of het onderzoeken van correlaties tussen blootstelling aan medicijnen en het optreden van aandoeningen. Ter referentie en begeleiding biedt de functie ook voorbeeldnotitieblokken voor deze scenario's.
OMOP-transformatie is een optionele mogelijkheid onder oplossingen voor gezondheidszorggegevens in Microsoft Fabric. U kunt zelf bepalen of u deze mogelijkheid wel of niet wilt gebruiken, afhankelijk van uw specifieke behoeften of scenario's.
Voor meer informatie over het implementeren, configureren en gebruiken van de OMOP-transformatiemogelijkheid, zie:
- OMOP-transformaties implementeren en configureren
- OMOP-transformaties gebruiken
- De voorbeeldnotitieblokken voor OMOP-transformaties gebruiken
Nadat u uw gegevens hebt getransformeerd in het OMOP-model, kunt u de gegevens ook bevragen en analyseren met behulp van de mogelijkheid Cohorten ontdekken en bouwen (preview) in oplossingen voor gezondheidszorggegevens.
Wat is opgenomen in OMOP CDM
Oplossingen voor gezondheidszorggegevens in Microsoft Fabric implementeren het OMOP Common Data Model versie 5.4, met de focus op het toewijzen van klinische FHIR-resources (Fast Healthcare Interoperability Resources) aan bijbehorende OMOP-tabellen in Fabric. Het volledige OMOP CDM-schema met alle tabellen is gevuld in het healthcare#_msft_gold_omop lakehouse. Alleen de klinische tabellen worden echter toegewezen aan FHIR-bronnen.
De tabellen onder Gestandaardiseerde gezondheidseconomie vallen buiten het bereik en zijn niet toegewezen aan FHIR-bronnen. Ze worden niet ingevuld nadat de transformatie-pipelines zijn uitgevoerd van het healthcare#_msft_silver lakehouse naar het healthcare#_msft_gold_omop lakehouse.
We nemen gestandaardiseerde vocabulaires op om terminologieën en codes uit klinische FHIR-resources toe te wijzen aan bijbehorende OMOP standaardconcepten in het klinische domein.
De Athena-gegevensset bevat verwijzingen naar domeinspecifieke vocabulaires.
Standaardvocabulaires die in de huidige release zijn opgenomen, zijn SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) en RxNorm.
