의료 데이터 솔루션에서 DICOM 데이터 변환 배포 및 구성
DICOM 데이터 변환을 사용하면 이미징 데이터 수집 파이프라인을 사용하고 DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine) 데이터를 OneLake로 가져올 수 있습니다. 의료 데이터 솔루션 및 의료 데이터 기반 기능을 Fabric 작업 영역에 배치한 후에 기능을 설정할 수 있습니다.
DICOM 데이터 변환은 Microsoft Fabric의 의료 데이터 솔루션에서 선택적 기능입니다. 특정 요구 사항이나 시나리오에 따라 사용 여부를 유연하게 결정할 수 있습니다.
사전 요구 사항
의료 데이터 기반 배포에 기초 Notebook과 파이프라인을 설치합니다.
샘플 데이터 배포에 설명된 대로 DICOM 이미징 샘플 데이터를 배포합니다.
OMOP 변환 파이프라인을 배포하고 구성합니다(선택 사항). 자세한 지침은 다음을 참조하세요.
DICOM 데이터 변환 배포
의료 데이터 솔루션: 의료 데이터 기반 배포에서 설명한 설정 모듈을 사용하여 해당 기능과 관련 샘플 데이터를 배포할 수 있습니다. 또는 샘플 데이터 배포의 단계에 따라 나중에 샘플 데이터를 배포할 수도 있습니다. 이 기능은 340ImagingStudies 샘플 데이터 세트를 사용합니다.
설치 모듈을 사용하여 기능을 배포하지 않고 대신 기능 타일을 사용하려면 다음 단계를 수행합니다.
Fabric의 의료 데이터 솔루션 홈 페이지로 이동합니다.
DICOM 데이터 변환 타일을 선택합니다.
기능 페이지에서 작업 영역에 배포를 선택합니다.
배포를 완료하는 데 몇 분 정도 걸릴 수 있습니다. 배포가 진행되는 동안 탭이나 브라우저를 닫지 마세요. 기다리는 동안 다른 탭에서 작업할 수 있습니다.
배포가 완료되면 메시지 표시줄에서 알림을 볼 수 있습니다.
메시지 표시줄에서 기능 관리를 선택하면 기능 관리 페이지로 이동합니다.
여기에서 기능과 함께 배포된 아티팩트를 보고, 구성하고, 관리할 수 있습니다.
아티팩트
이 기능은 의료 데이터 솔루션 환경에 다음 두 Notebook과 데이터 파이프라인을 설치합니다.
| 아티팩트 | Type | 설명 |
|---|---|---|
| healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion | 전자 필기장 | 의료 데이터 솔루션 라이브러리의 MetadataExtractionOrchestrator 모듈을 사용하여 DCM 파일에서 DICOM 메타데이터를 추출합니다. 그런 다음 메타데이터는 브론즈 레이크하우스의 ImagingDicom 델타 테이블에 저장됩니다. |
| healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion | 전자 필기장 | 의료 데이터 솔루션 라이브러리의 MetadataToFhirConvertor 모듈을 사용하여 브론즈 델타 테이블의 DICOM 메타데이터를 변환합니다. 변환 프로세스에는 ImagingDicom 테이블의 메타데이터를 FHIR R4.3 형식의 FHIR ImagingStudy 리소스로 변환하는 작업이 포함됩니다. 출력은 NDJSON 파일로 저장됩니다. |
| healthcare#_msft_imaging_with_clinical_foundation_ingestion | 데이터 파이프라인 | 순차적으로 다음 노트북을 실행하여 임상 FHIR NDJSON 데이터와 영상 DICOM 데이터를 청동 레이크하우스의 델타 테이블로 수집한 다음, 해당 데이터를 실버 레이크하우스로 평면화합니다. • msft_raw_process_movement: Ingest 폴더에서 Process 폴더로 파일을 이동하고 모든 파일 이름이 Process 폴더에 있는지 확인합니다. • msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion: 수집된 DICOM DCM 파일에서 메타데이터(DICOM 태그)를 추출합니다. • msft_imaging_dicom_fhir_conversion: 메타데이터를 NDJSON 형식의 ImagingStudy FHIR 표현으로 변환합니다. • msft_fhir_ndjson_bronze_ingestion: FHIR 및 ImagingStudy NDJSON 데이터를 Bronze 레이크하우스 내의 델타 테이블로 수집하는 작업을 촉진합니다. • msft_bronze_silver_flatten: 청동 레이크하우스의 데이터를 변환하고 평면화하여 실버 레이크하우스로 데이터를 수집합니다. |
DICOM 데이터 변환 Notebook은 연결된 데이터 파이프라인을 실행하는 데 필요한 미리 구성된 값으로 배포됩니다. 일부 구성 매개 변수는 전역 구성에서 상속됩니다. 기본적으로 Notebook 구성 파일은 변경할 필요가 없습니다. 필요한 경우 Notebook을 열고 구성을 검토할 수 있습니다.
이미징 샘플 데이터
의료 데이터 솔루션과 함께 제공되는 샘플 데이터에는 DICOM 데이터 변환 파이프라인을 실행하는 데 사용할 수 있는 이미징 샘플 데이터 세트가 포함되어 있습니다. 또한 메달리온 브론즈, 실버, 골드 레이크하우스를 통해 데이터 변환 및 진행 상황을 살펴볼 수 있습니다. 제공된 이미징 샘플 데이터는 임상적으로 의미가 없을 수 있지만 솔루션의 이미징 기능을 입증하기에 기술적으로 완전하고 포괄적입니다. 샘플 데이터 폴더에 액세스하려면 샘플 데이터 배포에서 설명한 대로 이미징 샘플 데이터세트 340ImagingStudies를 다운로드해야 합니다.
Azure Health Data Services에서 DICOM API 배포
중요
Azure Health Data Services에서 DICOM 서비스를 사용하는 경우에만 이 배포 섹션을 따릅니다.
Azure Health Data Services는 다양한 소스와 형식에서 의료 데이터를 수집, 저장 및 분석하는 데 도움이 되는 클라우드 기반 솔루션입니다. DICOM과 같은 다양한 의료 표준을 지원합니다. DICOM 서비스(Azure Health Data Services의 일부)는 의료 기관이 모든 DICOM 웹 지원 시스템 또는 애플리케이션과 의료 이미징 데이터를 안전하고 효율적으로 저장, 관리 및 교환할 수 있도록 하는 클라우드 기반 솔루션입니다.
의료 데이터 솔루션의 DICOM 데이터 변환은 DICOM 서비스와 기본적으로 통합됩니다. 이미 DICOM 서비스를 사용하고 있는 경우 의료 데이터 솔루션의 이미징 분석 기능을 사용할 수도 있습니다. 이 기본 통합은 두 서비스 간에 데이터 세트를 수동으로 통합할 필요가 없습니다. DICOM 파일을 OneLake 수집 폴더로 복사하거나 이동할 필요가 없습니다. 대신, Azure Health Data Services DICOM 서비스에 대한 Gen2로의 OneLake 바로가기 를 생성할 수 있습니다. Azure Data Lake Storage 데이터 레이크 통합 설정에 대한 자세한 내용은 다음을 참조하세요.
- DICOM 서비스를 사용하여 의료 영상 데이터를 관리합니다. Azure Data Lake Storage
- Azure Data Lake Storage를 사용하여 DICOM 서비스를 배포하세요.
이 수집 파이프라인에 대한 자세한 내용은 옵션 2: DICOM 서비스와의 통합을 참조하세요. 또는 Azure Health Data Services DICOM 서비스를 사용하지 않고도 Azure Data Lake Storage Gen2 스토리지에 저장된 DICOM 파일을 수집할 수 있습니다.