Přehled transformací OMOP v řešení pro zdravotní data
Cílem implementace jakéhokoli společného datového modelu je zavést standardizaci a zefektivnit strukturování, ukládání, sdílení, výměnu a používání dat. V řešeních pro zdravotní data můžete pomocí transformací OMOP nasadit společný datový model (CDM) Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) v prostředí datového jezera Fabric. Toto nasazení poskytuje výzkumníkům v rámci komunity OMOP přístup k rozsáhlému škálování OneLake a možnostem umělé inteligence platformy prostředků infrastruktury. Toto nastavení umožňuje efektivní a spolehlivé provádění standardizovaných analýz pro observační studie na úrovni pacientů a populace.
Nasazením OMOP CDM do prostředků infrastruktury pomocí předem připravených kanálů můžete pomocí poskytnutých poznámkových bloků vytvářet statistické modely, provádět studie rozložení populace a využívat Power BI sestavy k vizuálnímu porovnání různých intervencí a jejich účinků na výsledky pacientů. Tyto analytické schopnosti umožňují výzkumným pracovníkům provádět srovnávací analýzy, jako je hodnocení postupů a expozice drogám nebo zkoumání korelací mezi expozicí drogám a výskytem onemocnění. Pro referenci a pokyny poskytuje tato funkce také ukázkové poznámkové bloky pro tyto scénáře.
Transformace OMOP je volitelnou schopností v řešení pro zdravotní data v Microsoft Fabric. Můžete se flexibilně rozhodnout, zda jej použijete nebo ne, v závislosti na vašich konkrétních potřebách nebo scénářích.
Informace o tom, jak nasadit, nakonfigurovat a používat funkci transformace OMOP, najdete tady:
- Nasazení a konfigurace transformací OMOP
- Použití transformací OMOP
- Použití ukázkových poznámkových bloků transformací OMOP
Po transformaci dat do modelu OMOP můžete také dotazovat a analyzovat data pomocí schopnosti Zjišťování a sestavování kohort (Preview) v řešeních pro zdravotní data.
Co je zahrnuto v OMOP CDM
Řešení dat pro zdravotnictví v Microsoft Fabric implementují OMOP Common Data Model verze v5.4 se zaměřením na mapování klinických prostředků FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) na odpovídající tabulky OMOP v prostředcích infrastruktury. Kompletní schéma OMOP CDM se všemi tabulkami je naplněno v transakčním jezeře healthcare#_msft_gold_omop. Na prostředky FHIR jsou ale namapované jenom klinické tabulky.
Tabulky v části Standardizovaná zdravotní ekonomika jsou mimo rozsah a nejsou namapované na žádné prostředky FHIR. Po provedení transformačních kanálů z datového jezera healthcare#_msft_silver do datového jezera healthcare#_msft_gold_omop se nenaplní.
Zahrnujeme standardizované slovníky pro mapování terminologie a kódů z klinických zdrojů FHIR na odpovídající standardní pojmy OMOP v klinické doméně.
Datová sada Athena obsahuje odkazy na slovníky specifické pro doménu.
Standardní slovníky obsažené v aktuální verzi jsou SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) a RxNorm.
