Развертывание и настройка преобразования данных DICOM в решениях для данных здравоохранения
Заметка
В настоящее время это содержимое обновляется.
Преобразование данных DICOM позволяет использовать конвейер приема данных визуализации и переносить данные цифровой визуализации и коммуникаций в медицине (DICOM) в OneLake. Эту возможность можно настраивать после развертывания решений для данных здравоохранения и возможности механизмов структурирования данных здравоохранения в рабочей области Fabric.
Преобразование данных DICOM является дополнительной возможностью в решениях для данных здравоохранения в Microsoft Fabric. Вы можете решить, использовать его или нет, в зависимости от ваших конкретных потребностей или сценариев.
Предварительные условия
Развертывание решений для данных здравоохранения в Microsoft Fabric
Установите базовые записные книжки и конвейеры в Развертывание механизмов структурирования данных здравоохранения.
Разверните демонстрационные данные визуализации DICOM, как описано в разделе Развертывание демонстрационных данных.
Развертывание, настройка и запуск OMOP конвейеров преобразований (необязательно). Подробные инструкции см. в разделе:
Развертывание преобразования данных DICOM
Вы можете развернуть эту возможность и связанные с ней демонстрационные данные с помощью модуля настройки, описанного в разделе Решения для данных здравоохранения: развертывание механизмов структурирования данных здравоохранения. Кроме того, вы также можете развернуть демонстрационные данные позже, выполнив действия, описанные в разделе Развертывание демонстрационных данных. Эта возможность использует набор демонстрационных данных 340ImagingStudies.
Если вы не использовали модуль установки для развертывания возможности и хотите вместо этого использовать плитку возможностей, выполните следующие действия:
Перейдите на домашнюю страницу решений для данных здравоохранения в Fabric.
Выберите плитку преобразование данных DICOM.
На странице возможности выберите Развернуть в рабочей области.
Процесс развертывания может занять несколько минут. Не закрывайте вкладку или браузер во время развертывания. Пока вы ждете, вы можете работать в другой вкладке.
После завершения развертывания на панели сообщений появится уведомление.
Выберите Управление возможностью на панели сообщений, чтобы перейти на страницу Управление возможностями.
Здесь вы можете просматривать, настраивать и управлять артефактами, развернутыми с этой возможностью.
Артефакты
Эта возможность позволяет установить следующие две записные книжки и конвейер данных в среду решений для данных здравоохранения:
| Артефакт | Тип | Описание |
|---|---|---|
| healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion | Записная книжка | Использует модуль MetadataExtractionOrchestrator в библиотеке решений для данных здравоохранения для извлечения метаданных DICOM из файлов DCM. Затем метаданные хранятся в разностной таблице dicomimagingmetastore в бронзовом хранилище озера данных. |
| healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion | Записная книжка | Использует модуль MetadataToFhirConvertor в библиотеке решений для данных здравоохранения для преобразования метаданных DICOM в бронзовую разностную таблицу. Процесс преобразования включает в себя преобразование метаданных из таблицы dicomimagingmetastore в ресурс FHIR ImagingStudy в формате ресурса FHIR R4.3. Выходные данные сохраняются в виде файлов NDJSON. |
| healthcare#_msft_imaging_with_clinical_foundation_ingestion | Конвейер данных | Последовательно запускает следующие записные книжки для приема клинических данных FHIR NDJSON и данных визуализации DICOM в разностные таблицы в бронзовом хранилище озера данных, а затем сводит данные в серебряном хранилище озера данных: • healthcare#_msft_raw_process_movement: координирует перемещение файла из папки Прием в папку Обработка и обеспечивает наличие всех имен файлов в папке Обработка. • healthcare#_msft_imaging_dicom_extract_bronze_ingestion: извлекает метаданные (теги DICOM) из принятых файлов DICOM DCM. • healthcare#_msft_imaging_dicom_fhir_conversion: преобразует метаданные в представление FHIR ImagingStudy в формате NDJSON. • healthcare#_msft_fhir_ndjson_bronze_ingestion: облегчает прием данных FHIR и ImagingStudy NDJSON в разностные таблицы в бронзовом хранилище озера данных. • healthcare#_msft_bronze_silver_flatten: преобразует и сводит данные из бронзового хранилища озера данных и принимает данные в серебряное хранилище озера данных. |
Записные книжки преобразования данных DICOM развертываются с предварительно настроенными значениями, необходимыми для выполнения связанного конвейера данных. Некоторые параметры конфигурации наследуются от глобальной конфигурации. По умолчанию вносить какие-либо изменения в файлы конфигурации записной книжки не требуется. При необходимости можно открыть записную книжку и просмотреть конфигурацию.
Демонстрационные данные визуализации
Демонстрационные данные, поставляемые с решениями для данных здравоохранения, включают демонстрационные данные визуализации, которые можно использовать для запуска конвейера преобразования данных DICOM. Вы также можете исследовать преобразование данных и прогресс с помощью бронзовых, серебряных и золотых хранилищ озера данных. Предоставленные демонстрационные данные визуализации могут не иметь клинического значения, но они являются технически полными и исчерпывающими, чтобы продемонстрировать возможности визуализации решения. Чтобы получить доступ к папкам демонстрационных данных, убедитесь, что вы загрузили набор демонстрационные данные 340ImagingStudies , как описано в разделе Развернуть демонстрационные данные.
Развертывание API DICOM в Службах Azure для работы с медицинскими данными
Важно
Следуйте этому разделу развертывания только в том случае, если вы используете службу DICOM в Службах Azure для работы с медицинскими данными.
Службы Azure для работы с медицинскими данными — это облачное решение, которое помогает собирать, хранить и анализировать данные здравоохранения из разных источников и форматов. Он поддерживает различные медицинские стандарты, такие как DICOM. Служба DICOM (часть Служб Azure для работы с медицинскими данными) — это облачное решение, которое позволяет организациям здравоохранения безопасно и эффективно хранить, управлять и обмениваться данными медицинской визуализации с любыми системами или приложениями с веб-поддержкой DICOM.
Преобразование данных DICOM в решениях для обработки данных здравоохранения имеет встроенную интеграцию со службой DICOM. Если вы уже используете службу DICOM, вы также можете использовать возможности анализа изображений в решениях для данных здравоохранения. Такая встроенная интеграция устраняет необходимость в ручной интеграции наборов данных между двумя службами. Интеграция основана на предоставлении ярлыка OneLake для Azure Data Lake Storage 2-го поколения для службы DICOM Служб Azure для работы с медицинскими данными. Чтобы настроить интеграцию с хранилищем озера данных, выполните действия, описанные в разделе Развертывание службы DICOM с Azure Data Lake Storage. Дополнительные сведения об этом конвейере приема см. в разделе Вариант 2: сквозная интеграция со службой DICOM.
Настройка приема Azure Data Lake Storage
Следуйте этому параметру конфигурации "Использовать собственное хранилище данных" (BYOS), если вы хотите использовать файлы DICOM из хранилища Azure Data Lake Storage 2-го поколения. С помощью этого параметра вам не нужно копировать или перемещать файлы DICOM в папки приема OneLake. Вместо этого вы можете создать ярлык OneLake для Data Lake Storage 2-го поколения и получить доступ к файлам DICOM из их исходного места хранения.