Omówienie przekształceń OMOP w rozwiązaniach do obsługi danych medycznych
Celem wdrożenia dowolnego wspólnego modelu danych jest ustanowienie standaryzacji i usprawnienie strukturyzacji, przechowywania, udostępniania, wymiany i wykorzystywania danych. W rozwiązaniach danych opieki zdrowotnej można użyć przekształceń OMOP, aby wdrożyć wspólny model danych (CDM) partnerstwa Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) w środowisku magazynu lakehouse usługi Fabric. To wdrożenie zapewnia badaczom w społeczności OMOP dostęp do ekspansywnej skali OneLake i możliwości sztucznej inteligencji platformy Fabric. Konfiguracja umożliwia wydajne i niezawodne wykonywanie standaryzowanych analiz dla badań obserwacyjnych na poziomie pacjentów i populacji.
Wdrażając OMOP CDM w Fabric przy użyciu wstępnie utworzonych potoków, można używać dostarczonych notesów do konstruowania modeli statystycznych, przeprowadzania badań rozmieszczenia populacji i wykorzystywania raportów Power BI do wizualnego porównywania różnych interwencji i ich wpływu na wyniki pacjentów. Te możliwości analityczne umożliwiają naukowcom przeprowadzanie analiz porównawczych, takich jak ocena procedur i ekspozycji na leki lub badanie korelacji między ekspozycją na leki a występowaniem chorób. W celach referencyjnych i doradczych funkcja udostępnia również przykładowe notesy dla tych scenariuszy.
Przekształcanie OMOP jest opcjonalną możliwością w rozwiązaniach do obsługi danych medycznych w Microsoft Fabric. Masz swobodę decydowania, czy chcesz go używać, w zależności od konkretnych potrzeb lub scenariuszy.
Aby dowiedzieć się, jak wdrażać, konfigurować i używać funkcji przekształceń OMOP, zobacz:
- Wdrażanie i konfigurowanie przekształceń OMOP
- Używanie przekształceń OMOP
- Używanie przykładowych notesów przekształceń OMOP
Po przekształceniu danych w model OMOP można również wykonywać zapytania i analizować dane przy użyciu funkcji Odnajdywania i kompilowania kohort (wersja zapoznawcza) w rozwiązaniach do obsługi danych medycznych.
Co wchodzi w skład w OMOP CDM
Rozwiązania do obsługi danych medycznych w Microsoft Fabric implementują OMOPCommon Data Model w wersji 5.4 z naciskiem na mapowanie zasobów klinicznych Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) na odpowiednie tabele OMOP w Fabric. Kompletny schemat OMOP CDM ze wszystkimi tabelami jest wypełniany w magazynie lakehouse healthcare#_msft_gold_omop. Jednak tylko tabele kliniczne są mapowane na zasoby FHIR.
Tabele w obszarze Ustandaryzowana ekonomia zdrowia są poza zakresem i nie są mapowane na żadne zasoby FHIR. Nie zostaną one wypełnione po wykonaniu potoków transformacji z magazynu lakehouse healthcare#_msft_silver do healthcare#_msft_gold_omop.
Dołączamy Ustandaryzowane słownictwo do mapowania terminologii i kodów z zasobów klinicznych FHIR na odpowiednie standardowe pojęcia OMOP w domenie klinicznej.
Zestaw danych Athena zawiera odwołania do słowników specyficznych dla danej dziedziny.
Standardowe słownictwo zawarte w bieżącym wydaniu to SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) i RxNorm.