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의료 데이터 솔루션에서 OMOP 변환 개요

Common Data Model을 구현하는 목적은 표준화를 확립하고 데이터의 구조화, 저장, 공유, 교환 및 사용을 간소화하는 것입니다. 의료 데이터 솔루션에서는 OMOP 변환을 사용하여 Fabric 레이크하우스 환경에 OMOP(Observational Medical Outcomes Partnership) Common Data Model(CDM)을 배포할 수 있습니다. 이 배포를 통해 OMOP 커뮤니티 내의 연구원들은 OneLake의 광범위한 규모와 Fabric 플랫폼의 AI 기능에 액세스할 수 있습니다. 이 설정을 통해 환자 및 인구 집단 수준의 관찰 연구를 위한 표준화된 분석을 효율적이고 안정적으로 실행할 수 있습니다.

사전 구축된 파이프라인을 사용하여 OMOP CDM을 Fabric에 배포하면 제공된 Notebook을 사용하여 통계 모델을 구성하고, 모집단 분포 연구를 수행하고, Power BI 보고서를 활용하여 다양한 개입과 환자 결과에 미치는 영향을 시각적으로 비교할 수 있습니다. 이러한 분석 기능을 통해 연구원은 절차 및 약물 노출 평가 또는 약물 노출과 상태 발생 간의 상관 관계 조사와 같은 비교 분석을 수행할 수 있습니다. 참조 및 지침을 위해 이 기능은 이러한 시나리오에 대한 샘플 Notebook도 제공합니다.

OMOP 변환은 Microsoft Fabric의 의료 데이터 솔루션에서 선택적 기능입니다. 특정 요구 사항이나 시나리오에 따라 사용 여부를 유연하게 결정할 수 있습니다.

OMOP 변환 기능을 배포, 구성 및 사용하는 방법에 대한 자세한 내용은 다음을 참조하세요.

데이터를 OMOP 모델로 변환한 후에는 의료 데이터 솔루션의 코호트 검색 및 구축(프리뷰) 기능을 사용하여 데이터를 쿼리하고 분석할 수도 있습니다.

OMOP CDM에 포함된 기능

Microsoft Fabric의 의료 데이터 솔루션은 FHIR(전자 의료 기록 교환) 임상 리소스를 Fabric의 해당 OMOP 테이블에 매핑하는 데 초점을 맞춘 OMOP Common Data Model 버전 v5.4를 구현합니다. 모든 테이블이 포함된 전체 OMOP CDM 스키마는 healthcare#_msft_gold_omop 레이크하우스에 채워집니다. 그러나 임상 테이블만 FHIR 리소스에 매핑됩니다.

  • 표준화된 건강 경제학에 있는 표는 범위를 벗어나며 어떤 FHIR 리소스에도 매핑되지 않았습니다. healthcare#_msft_silver 레이크하우스에서 healthcare#_msft_gold_omop 레이크하우스로 변환 파이프라인이 실행된 후에는 채워지지 않습니다.

  • FHIR 임상 자료의 용어와 코드를 임상 분야의 해당 OMOP 표준 개념에 매핑하기 위해 표준화된 어휘집을 포함했습니다.

    Athena 데이터 세트에는 도메인별 어휘집에 대한 참조가 포함되어 있습니다.

  • 현재 릴리스에 포함된 표준 어휘집은 SNOMED-CT(Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC(Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) 및 RxNorm입니다.

OMOP Common Data Model 설명을 표시하는 이미지.