医療データ ソリューションの OMOP 変換に関する概要
共通データ モデルを実装する目的は、標準化を確立し、データの構造化、保存、共有、交換、および使用を合理化することです。 医療データ ソリューションでは、OMOP 変換を使用して、Fabric レイクハウス環境に Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) 共通データ モデル (CDM) を展開できます。 この展開により、OMOP コミュニティ内の研究者は、OneLake の広大なスケールと Fabric プラットフォームの AI 機能にアクセスできます。 この設定により、患者および集団レベルでの観察研究のための標準化された分析を効率的かつ確実に実行することができます。
事前構築済みのパイプラインを使用して OMOP CDM を Fabric に展開することで、提供されたノートブックを使用して統計モデルを構築し、人口分布調査を実施し、Power BI レポートを利用して、さまざまな治療と患者の転帰への影響を視覚的に比較できます。 これらの分析機能により、研究者は、処置や薬物曝露を評価したり、薬物曝露と病態発生との相関関係を調べたりするなどの比較分析を実行できます。 参照とガイダンスのために、この機能には、これらのシナリオのサンプル ノートブックも用意されています。
OMOP 変換は、Microsoft Fabric の医療データ ソリューションのオプション機能です。 特定のニーズやシナリオに応じて、使用するかどうかを柔軟に決定できます。
OMOP 変換機能の展開、構成および使用方法については、以下を参照してください:
データを OMOP モデルに変換した後、医療データ ソリューションの コーホートの検出と構築 (プレビュー) 機能を使用して、データのクエリと分析を行うこともできます。
OMOP CDM に含まれるもの
Microsoft Fabric の医療データ ソリューションは、高速ヘルスケア相互運用性リソース (FHIR) の臨床リソースを Fabric の対応する OMOP テーブルにマッピングすることに重点を置いて、OMOP Common Data Model バージョン v5.4 を実装します。 すべてのテーブルを含む完全な OMOP CDM スキーマは、 healthcare#_msft_gold_omop レイクハウスに入力されます。 ただし、FHIR リソースにマップされるのは臨床テーブルのみです。
標準化された医療経済 の下のテーブルは範囲外であり、どの FHIR リソースにもマップされていません。 これらは、変換パイプラインが healthcare#_msft_silver レイクハウスから healthcare#_msft_gold_omop レイクハウスに実行された後は入力されません。
FHIR 臨床リソースの用語とコードを、臨床ドメインの対応する OMOP 標準概念にマップするための 標準ボキャブラリ を含みます。
Athena データ セット には、ドメイン固有ボキャブラリへの参照が含まれています。
現在のリリースに含まれる標準ボキャブラリは、SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms)、LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes)、および RxNorm です。
