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Überblick über OMOP-Transformationen in Datenlösungen für das Gesundheitswesen

Das Ziel der Implementierung eines gemeinsamen Datenmodells ist es, eine Standardisierung zu erreichen und die Strukturierung, Speicherung, gemeinsame Nutzung, den Austausch und die Nutzung von Daten zu optimieren. In Datenlösungen für das Gesundheitswesen können Sie OMOP-Transformationen verwenden, um das Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) Common Data Model (CDM) in der Lakehouse-Umgebung von Fabric bereitzustellen. Diese Bereitstellung bietet Forschern innerhalb der OMOP-Community Zugriff auf den umfangreichen Geltungsbereich von OneLake und die KI-Funktionen der Fabric-Plattform. Die Einrichtung ermöglicht eine effiziente und zuverlässige Durchführung standardisierter Analysen für Beobachtungsstudien auf Patienten- und Bevölkerungsebene.

Durch die Bereitstellung des OMOP CDM in Fabric mithilfe vorgefertigter Pipelines können Sie die bereitgestellten Notebooks verwenden, um statistische Modelle zu erstellen, Studien zur Bevölkerungsverteilung durchzuführen und Power BI- Berichte zu verwenden, um verschiedene Interventionen und ihre Auswirkungen auf die Patientenergebnisse visuell zu vergleichen. Diese analytischen Fähigkeiten ermöglichen es den Forschern, vergleichende Analysen durchzuführen, wie z. B. die Bewertung von Verfahren und Arzneimittelexpositionen oder die Untersuchung von Korrelationen zwischen Arzneimittelexpositionen und dem Auftreten von Erkrankungen. Als Referenz und Hilfe stellt die Funktion auch Beispiel-Notebooks für diese Szenarien bereit.

OMOP-Transformationen ist eine optionale Funktion in den Datenlösungen für das Gesundheitswesen in Microsoft Fabric. Sie haben die Flexibilität zu entscheiden, ob Sie es verwenden möchten oder nicht, abhängig von Ihren spezifischen Anforderungen oder Szenarien.

Weitere Informationen zur Bereitstellung, Konfiguration und Verwendung der Funktion OMOP-Transformationen:

Nachdem Sie Ihre Daten in das OMOP Modell transformiert haben, können Sie die Daten auch mithilfe der Funktion Kohorten ermitteln und erstellen (Vorschauversion) in Datenlösungen für das Gesundheitswesen abfragen und analysieren.

In OMOP CDM enthaltene Komponenten

Datenlösungen für das Gesundheitswesen in Microsoft Fabric implementieren das OMOP Common Data Model Version v5.4 mit Schwerpunkt auf der Zuordnung klinischer FHIR-Ressourcen zu entsprechenden OMOP-Tabellen in Fabric. Das vollständige OMOP-CDM-Schema mit all seinen Tabellen wird im Lakehousehealthcare#_msft_gold_omop aufgefüllt. Es werden jedoch nur die klinischen Tabellen FHIR-Ressourcen zugeordnet.

  • Die Tabellen unter Standardisierte Gesundheitsökonomie liegen außerhalb des Geltungsbereichs und werden keinen FHIR-Ressourcen zugeordnet. Sie werden nicht aufgefüllt, nachdem die Transformationspipelines vom Lakehouse healthcare#_msft_silver zum Lakehouse healthcare#_msft_gold_omop ausgeführt wurden.

  • Wir integrieren standardisierte Vokabulare, um Terminologien und Codes aus klinischen FHIR-Ressourcen den entsprechenden OMOP-Standardkonzepten im klinischen Bereich zuzuordnen.

    Das Athena-Datenset enthält Verweise auf domänenspezifische Vokabulare.

  • Zu den Standardvokabularen, die in der aktuellen Version enthalten sind, gehören SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names and Codes) und RxNorm.

Abbildung des OMOP Common Data Model