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使用 R 來檢視及摘要 SQL Server 資料 (逐步解說)

適用於: SQL Server 2016 (13.x) 和更新版本

本課程會向您介紹 RevoScaleR 套件中的函式,並逐步引導您完成下列工作:

  • 連接至 SQL Server
  • 定義具有您所需資料的查詢,或是指定資料表或檢視
  • 定義一或多個在執行 R 程式碼時要使用的計算內容
  • (選擇性) 定義從來源讀取資料來源時,套用至該資料來源的轉換

定義 SQL Server 計算內容

在用戶端工作站上的 R 環境中執行下列 R 陳述式。 本節會假設有一個具有 Microsoft R Client 的 資料科學工作站,因為它包含所有 RevoScaleR 套件,以及一組基本、輕量型的 R 工具。 例如,您可以使用 Rgui.exe 來執行本節中的 R 指令碼。

  1. 如果尚未載入 RevoScaleR 封裝,請執行這一行 R 程式碼:

    library("RevoScaleR")
    

    引號是選擇性的,不過,在此案例中建議使用。

    如果您收到錯誤,請確定 R 開發環境使用包含 RevoScaleR 套件的程式庫。 使用 .libPaths() 之類的命令來檢視目前的程式庫路徑。

  2. 建立 SQL Server 的連接字串,並將其儲存在 R 變數 connStr 中。

    您必須將預留位置 "your_server_name" 變更為有效的 SQL Server 執行個體名稱。 在伺服器名稱方面,視您的網路而定,您可能可以只使用執行個體名稱,或是可能需要完整限定該名稱。

    SQL Server 驗證的連線語法如下:

    connStr <- "Driver=SQL Server;Server=your_server_name;Database=nyctaxi_sample;Uid=your-sql-login;Pwd=your-login-password"
    

    Windows 驗證的語法略有不同:

    connStr <- "Driver=SQL Server;Server=your_server_name;Database=nyctaxi_sample;Trusted_Connection=True"
    

    一般而言,建議您儘可能使用 Windows 驗證,以避免在 R 程式碼中儲存密碼。

  3. 定義要用於建立新「計算內容」 的變數。 建立計算內容物件之後,您可以使用它在 SQL Server 執行個體上執行 R 程式碼。

    sqlShareDir <- paste("C:\\AllShare\\",Sys.getenv("USERNAME"),sep="")
    sqlWait <- TRUE
    sqlConsoleOutput <- FALSE
    
    • 在工作站與 SQL Server 電腦之間來回序列化 R 物件時,R 會使用暫存目錄。 您可以指定本機目錄以用來做為 sqlShareDir,或接受預設值。

    • 使用 sqlWait 來指出您是否想讓 R 等待來自伺服器的結果。 如需有關等待與非等待作業之比較的討論,請參閱 Microsoft R 中 RevoScaleR 的分散式計算與平行計算

    • 使用引數 sqlConsoleOutput 來指出您不想看到來自 R 主控台的輸出。

  4. 您需呼叫 RxInSqlServer建構函式,以使用變數和已經定義的連接字串來建立計算內容物件,並將新物件儲存在 R 變數 sqlcc 中。

    sqlcc <- RxInSqlServer(connectionString = connStr, shareDir = sqlShareDir, wait = sqlWait, consoleOutput = sqlConsoleOutput)
    
  5. 計算內容預設為本機內容,因此您必須明確設定「作用中」 計算內容。

    rxSetComputeContext(sqlcc)
    

    請注意,設定計算內容只會影響使用 RevoScaleR 套件中函式的作業;計算內容不會影響開放原始碼 R 作業的執行方式。

使用 RxSqlServer 來建立資料來源

使用 Microsoft R 程式庫 (例如 RevoScaleR 和 MicrosoftML) 時,「資料來源」 係指您使用 RevoScaleR 函式來建立的物件。 資料來源物件會指定您要用於工作 (例如模型定型或特徵擷取) 的某組資料。 您可以從各種來源 (包括 SQL Server) 取得資料。 如需目前支援的來源清單,請參閱 RxDataSource \(英文\)。

您在稍早已定義連接字串,並將該資訊儲存在 R 變數中。 您可以重複使用該連線資訊來指定想要取得的資料。

  1. 將 SQL 查詢儲存為字串變數。 此查詢會定義用於將模型定型的資料。

    sampleDataQuery <- "SELECT TOP 1000 tipped, fare_amount, passenger_count,trip_time_in_secs,trip_distance, pickup_datetime, dropoff_datetime, pickup_longitude, pickup_latitude, dropoff_longitude, dropoff_latitude FROM nyctaxi_sample"
    

    我們在這裡使用了 TOP 子句來加快執行速度,但查詢所傳回的實際資料列可能依順序而有所不同。 因此,您的摘要結果可能也與下面所列出的不同。 請隨意移除 TOP 子句。

  2. 將查詢定義做為引數傳遞至 RxSqlServerData 函數。

    inDataSource <- RxSqlServerData(
      sqlQuery = sampleDataQuery,
      connectionString = connStr,
      colClasses = c(pickup_longitude = "numeric", pickup_latitude = "numeric",
      dropoff_longitude = "numeric", dropoff_latitude = "numeric"),
      rowsPerRead=500
      )
    
    • 引數 colClasses 會指定在 SQL Server 和 R 之間移動資料時要使用的資料行類型。這很重要,因為 SQL Server 會使用與 R 不同的資料類型,而且具有更多資料類型。 如需詳細資訊,請參閱 R 程式庫和資料類型

    • 引數 rowsPerRead 對於管理記憶體使用量和有效率的計算而言很重要。 R Services (資料庫內) 中的大多數增強型分析函數會分區塊處理資料並累積中繼結果,然後在讀取所有資料之後,傳回最終計算結果。 藉由新增 rowsPerRead 參數,您可以控制讀入每個區塊以進行處理的資料列數目。 如果此參數的值太大,資料存取可能會較慢,因為您沒有足夠的記憶體,無法有效率地處理這樣大的資料區塊。 在某些系統上,將 rowsPerRead 設定為過小的值也可能使效能變慢。

  3. 目前,您已建立 inDataSource 物件,但它並未包含任何資料。 必須在您執行 rxImportrxSummary之類的函式之後,才會將資料從 SQL 查詢提取至本機環境。

    不過,既然您已定義資料物件,您便可以使用它作為其他函式的引數。

在 R 摘要中使用 SQL Server 資料

在本節中,您將試用 R Services (資料庫內) 中所提供、數個支援遠端計算內容的函數。 您可以將 R 函數套用至資料來源,來探索、摘要 SQL Server 資料及為其繪製圖表。

  1. 呼叫函式 rxGetVarInfo以取得資料來源中之變數及其資料類型的清單。

    rxGetVarInfo 是一個便利的函式;您可以在任何資料框架上或在遠端資料物件中的一組資料上呼叫它,以取得最大值和最小值、資料類型,以及因數資料行中的層級數目等資訊。

    考量在任何類型的資料輸入、特徵轉換或特徵工程之後執行此函數。 這樣做可確保您要在模型中使用的所有特徵都屬於預期的資料類型,而避免發生錯誤。

    rxGetVarInfo(data = inDataSource)
    

    結果

    Var 1: tipped, Type: integer
    Var 2: fare_amount, Type: numeric
    Var 3: passenger_count, Type: integer
    Var 4: trip_time_in_secs, Type: numeric, Storage: int64
    Var 5: trip_distance, Type: numeric
    Var 6: pickup_datetime, Type: character
    Var 7: dropoff_datetime, Type: character
    Var 8: pickup_longitude, Type: numeric
    Var 9: pickup_latitude, Type: numeric
    Var 10: dropoff_longitude, Type: numeric
    
  2. 現在,呼叫 RevoScaleR 函式 rxSummary 以取得有關個別變數的更詳細統計資料。

    rxSummary 以 R summary 函式為基礎,但有一些額外的功能和優點。 rxSummary 可在多個計算內容中運作,並且支援區塊化。 您也可以使用 rxSummary 來轉換值,或根據因數層級進行摘要。

    在此範例中,您會根據乘客數來摘要費用金額。

    start.time <- proc.time()
    rxSummary(~fare_amount:F(passenger_count,1,6), data = inDataSource)
    used.time <- proc.time() - start.time
    print(paste("It takes CPU Time=", round(used.time[1]+used.time[2],2)," seconds,
      Elapsed Time=", round(used.time[3],2),
      " seconds to summarize the inDataSource.", sep=""))
    
    • rxSummary 的第一個引數會指定作為摘要方式的公式或詞彙。 此處的 F() 函數可用來將 passenger_count 中的值轉換成因素,再進行摘要。 您也必須指定 passenger_count 因數變數的最小值 (1) 和最大值 (6)。
    • 如果您未指定要輸出的統計資料,rxSummary 預設會輸出平均值、標準差、最小值、最大值,以及有效和遺失的觀察值。
    • 此範例也會包含一些程式碼來追蹤函數的開始和完成時間,讓您可以比較效能。

    結果

    如果 rxSummary 函式成功執行,您應該會看到類似以下的結果,後面接著依類別區分的統計資料清單。

    rxSummary(formula = ~fare_amount:F(passenger_count, 1,6), data = inDataSource)
    Data: inDataSource (RxSqlServerData Data Source)
    Number of valid observations: 1000
    

巨量資料的額外練習

嘗試使用所有資料列來定義新的查詢字串。 建議您為此實驗設定一個新的資料來源物件。 您也可以嘗試變更 rowsToRead 參數,來查看它如何影響輸送量。

bigDataQuery  <- "SELECT tipped, fare_amount, passenger_count,trip_time_in_secs,trip_distance, pickup_datetime, dropoff_datetime, pickup_longitude, pickup_latitude, dropoff_longitude, dropoff_latitude FROM nyctaxi_sample"

bigDataSource <- RxSqlServerData(
      sqlQuery = bigDataQuery,
      connectionString = connStr,
      colClasses = c(pickup_longitude = "numeric", pickup_latitude = "numeric",
      dropoff_longitude = "numeric", dropoff_latitude = "numeric"),
      rowsPerRead=500
      )

start.time <- proc.time()
rxSummary(~fare_amount:F(passenger_count,1,6), data = bigDataSource)
used.time <- proc.time() - start.time
print(paste("It takes CPU Time=", round(used.time[1]+used.time[2],2)," seconds,
  Elapsed Time=", round(used.time[3],2),
  " seconds to summarize the inDataSource.", sep=""))

提示

當此作業執行時,您可以使用處理序總管 或 SQL Profiler 之類的工具,來查看如何使用 SQL Server 服務來建立連線及執行 R 程式碼。

後續步驟