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开放目标

开放目标平台是一种数据资源,用于促进潜在治疗药物目标的系统识别和优先顺序。 此资源集成了公开可用的数据集(包括开放目标联盟生成的数据集),以构建目标疾病关联并进行评分,从而帮助确定药物目标并确定优先顺序。 此外,它还纳入了有关目标、疾病、表型、药物及其关键关系的相关注释信息。

开放目标遗传学强调以变异为中心的统计证据,以允许在与特征相关的位点优先考虑候选因果变异,并识别潜在的药物目标。 它收集并整合了来自已发表文献的遗传关联数据,以及从例如 UK Biobank 和 FinnGen 等来源新衍生的数据。 此外,它还包括功能基因组学信息,如如染色质构象和相互作用,以及定量性状位点(eQTLs、pQTLs 和 sQTLs)。 大规模管道可跨数千个特征相关位点应用统计精细映射,以解决关联信号,并使用“Locus2Gene”评估将每个变体链接到其近端和远端目标基因。 集成的跨性状共定位分析以及与详细药物化合物的链接扩展了开放目标遗传学的能力,以探索药物再利用的机会和共享遗传结构。

注意

Microsoft 按“原样”提供 Azure 开放数据集。 Microsoft 对数据集的使用不提供任何担保(明示或暗示)、保证或条件。 在当地法律允许的范围内,Microsoft 对使用数据集而导致的任何损害或损失不承担任何责任,包括直接、必然、特殊、间接、偶发或惩罚性损害或损失。

此数据集是根据 Microsoft 接收源数据的原始条款提供的。 数据集可能包含来自 Microsoft 的数据。

数据源

此数据集是 http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latesthttp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/ 的镜像

数据量和更新频率

该数据集大约包含 350 GB 数据,并且每天更新。

存储位置

此数据集存储在美国西部 2 Azure 区域。 建议在美国西部 2 中分配计算资源以实现相关性。

数据访问

美国西部 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

使用条款

请参阅此处所述的数据使用条款。

联系人

https://www.internationalgenome.org/contact

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