Dela via

Öppna mål

  • Artikel

Open Targets Platform är en dataresurs för att underlätta systematisk identifiering och prioritering av potentiella terapeutiska läkemedelsmål. Den här resursen integrerar offentligt tillgängliga datamängder, inklusive de datauppsättningar som genereras av konsortiet Open Targets, för att bygga och poängsätta målsjukdomsassociationer, med hjälp av identifiering och prioritering av narkotikamål. Dessutom innehåller den relevant anteckningsinformation om mål, sjukdomar, fenotyper, läkemedel och deras nyckelrelationer.

Open Targets Genetics belyser variantcentrerade statistiska bevis för att tillåta både prioritering av kandidat kausala varianter vid dragassoci och identifiering av potentiella läkemedelsmål. Den samlar in och kombinerar genetiska associationer som samlats in från publicerad litteratur samt nyligen härledda data från källor som UK Biobank och FinnGen. Dessutom innehåller den funktionell genomikinformation som kromatinkonformation och interaktioner, tillsammans med kvantitativ egenskapsloci (eQTLs, pQTLs och sQTLs). Storskaliga pipelines tillämpar statistisk finmappning över tusentals dragassoci för att lösa associationssignaler och länka varje variant till dess proximala och distala målgener med hjälp av en "Locus2Gene"-bedömning. Integrerade samlokaliseringsanalyser mellan olika drag och länkning till detaljerade farmaceutiska föreningar utökar kapaciteten hos Open Targets Genetics för att utforska möjligheter till ompositionering av läkemedel och delad genetisk arkitektur.

Kommentar

Microsoft tillhandahåller Azure Open Datasets i befintligt fall. Microsoft ger inga garantier, uttryckliga eller underförstådda garantier eller villkor för din användning av datauppsättningarna. I den utsträckning som tillåts enligt din lokala lag frånsäger sig Microsoft allt ansvar för eventuella skador eller förluster, inklusive direkt, följdriktig, särskild, indirekt, tillfällig eller straffbar, till följd av din användning av datauppsättningarna.

Datamängden tillhandahålls enligt de ursprungliga villkor som gällde när Microsoft tog emot källdatan. Datamängden kan innehålla data från Microsoft.

Data source

Den här datamängden är en spegling av http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest och http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/

Datavolymer och uppdateringsfrekvens

Den här datamängden innehåller cirka 350 GB data och uppdateras dagligen.

Lagringsplats

Den här datamängden lagras i Azure-regionen USA, västra 2. Allokering av beräkningsresurser i USA, västra 2 rekommenderas för tillhörighet.

Dataåtkomst

USA, västra 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

Användningsvillkor 

Se användningsvillkoren för data enligt beskrivningen här.

Kontakt

https://www.internationalgenome.org/contact

Visa resten av datauppsättningarna i katalogen Öppna datamängder.