Обзор преобразований OMOP в решениях для данных здравоохранения
Целью реализации любой общей модели данных является стандартизация и оптимизация структурирования, хранения, совместного использования, обмена и использования данных. В решениях для данных здравоохранения можно использовать OMOP преобразования для развертывания общей модели данных (CDM) Сообщества по наблюдению за медицинскими результатами (OMOP) в среде озера данных Fabric. Это развертывание предоставляет исследователям в OMOP сообществе доступ к обширному масштабу OneLake и возможностям ИИ платформы Fabric. Эта настройка позволяет эффективно и надежно выполнять стандартизированную аналитику для обсервационных исследований на уровне пациентов и популяций.
Развернув OMOP CDM в Fabric с помощью предварительно созданных конвейеров, вы можете использовать предоставленные записные книжки для построения статистических моделей, проведения исследований распределения населения и использования Power BI отчетов для визуального сравнения различных вмешательств и их влияния на результаты лечения пациентов. Эти аналитические возможности позволяют исследователям проводить сравнительный анализ, например, оценивать процедуры и воздействие препаратов или изучать корреляции между воздействием препаратов и возникновением заболеваний. В качестве справочной информации и рекомендаций эта возможность также предоставляет примеры записных книжек для этих сценариев.
Преобразования OMOP является дополнительной возможностью в решениях для данных здравоохранения в Microsoft Fabric. Вы можете решить, использовать его или нет, в зависимости от ваших конкретных потребностей или сценариев.
Сведения о развертывании, настройке и использовании возможности преобразований OMOP см. в разделе:
- Развертывание и конфигурация преобразований OMOP
- Использование преобразований OMOP
- Использование примеров записных книжек преобразований OMOP
После преобразования данных в OMOP модель вы также можете запрашивать и анализировать данные с помощью возможности обнаружения и создания когорт (предварительная версия) в решениях для данных здравоохранения.
Что входит в OMOP CDM
Решения для данных здравоохранения в Microsoft Fabric реализуют OMOP Common Data Model версии v5.4 с акцентом на сопоставление клинических ресурсов быстрого взаимодействия в сфере здравоохранения (FHIR) с соответствующими OMOP таблицами в Fabric. Полная схема OMOP CDM со всеми ее таблицами заполняется в хранилище озера данных healthcare#_msft_gold_omop. Однако с ресурсами FHIR сопоставляются только клинические таблицы.
Таблицы в разделе Стандартизированная экономика здравоохранения выходят за рамки и не сопоставлены с ресурсами FHIR. Они не будут заполнены после выполнения конвейеров преобразования из lakehouse healthcare#_msft_silver в lakehouse healthcare#_msft_gold_omop.
Мы включаем стандартизированные словари для сопоставления терминологии и кодов из клинических ресурсов FHIR с соответствующими OMOP стандартными концепциями в клинической области.
Набор данных Athena содержит ссылки на словари, относящиеся к предметной области.
Стандартизированные словари, включенные в текущий выпуск: SNOMED-CT (Систематизированная номенклатура медицины — клиническая терминология), LOINC (Логические идентификаторы, имена и коды наблюдений) и RxNorm.
