Поделиться через

Открытие целевых объектов

  • Статья

Платформа Open Targets — это ресурс данных для упрощения систематической идентификации и приоритета потенциальных целевых целей лечения наркотиков. Этот ресурс интегрирует общедоступные наборы данных, в том числе те наборы данных, которые создаются консорциумом Open Targets, для создания и оценки ассоциаций целевых заболеваний, помогая в выявлении и приоритете целевых целей наркотиков. Кроме того, он включает соответствующие сведения о целевых объектах, заболеваниях, фенотипах, наркотиках и их ключевых отношениях.

Open Targets Genetics выделяет вариантно-ориентированные статистические доказательства, чтобы позволить обе приоритетности кандидатов причинных вариантов при признаках, связанных с локусами и идентификацией потенциальных целей наркотиков. Он собирает и объединяет генетические ассоциации, собранные из опубликованной литературы, а также новые производные данные из источников, таких как UK Biobank и FinnGen. Кроме того, она включает в себя функциональные данные геномики, такие как соответствие хроматин и взаимодействия, а также количественные признаки loci (eQTLs, pQTLs и SQTLs). Крупномасштабные конвейеры применяют статистическое точное сопоставление между тысячами связанных с признаками лоци для разрешения сигналов ассоциации и связывания каждого варианта с его проксимальными и дистальными целевыми генами с помощью оценки Locus2Gene. Интегрированные анализы колокализации между чертами и связывание с подробными фармацевтическими соединениями расширяют емкость Open Targets Genetics для изучения возможностей перепозиции наркотиков и общей генетической архитектуры.

Примечание.

Корпорация Майкрософт предоставляет Открытые наборы данных Azure как есть. Корпорация Майкрософт не предоставляет никаких гарантий (явных или подразумеваемых) и не определяет никаких условий в связи с использованием этих наборов данных. В рамках, допускаемых местным законодательством, корпорация Майкрософт отказывается от ответственности за ущерб и убытки (в том числе прямые, косвенные, специальные, опосредованные, случайные и штрафные), понесенные в результате использования вами этих наборов данных.

Этот набор данных предоставляется на тех же условиях, на которых корпорация Майкрософт получила исходные данные. Этот набор может включать данные, полученные от корпорации Майкрософт.

Источник данных

Этот набор данных является зеркалом http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest и http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/

Объемы данных и частота обновления

Этот набор данных содержит около 350 ГБ данных и обновляется ежедневно.

Место хранения

Этот набор данных хранится в регионе Azure "Западная часть США 2". Выделение вычислительных ресурсов в западной части США 2 рекомендуется для сходства.

Доступ к данным

Западная часть США 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

Условия использования 

Ознакомьтесь с условиями использования данных, как описано здесь.

Контакт

https://www.internationalgenome.org/contact

Ознакомьтесь с другими наборами в каталоге Открытых наборов данных.