Поделиться через

Пакет ресурсов GATK

  • Статья

Пакет ресурсов GATK — это набор стандартных файлов для работы с данными ресеквенирования генома человека с использованием GATK.

Примечание.

Корпорация Майкрософт предоставляет Открытые наборы данных Azure как есть. Корпорация Майкрософт не предоставляет никаких гарантий (явных или подразумеваемых) и не определяет никаких условий в связи с использованием этих наборов данных. В рамках, допускаемых местным законодательством, корпорация Майкрософт отказывается от ответственности за ущерб и убытки (в том числе прямые, косвенные, специальные, опосредованные, случайные и штрафные), понесенные в результате использования вами этих наборов данных.

Этот набор данных предоставляется на тех же условиях, на которых корпорация Майкрософт получила исходные данные. Этот набор может включать данные, полученные от корпорации Майкрософт.

Источник данных

Этот набор данных является зеркальным по отношению к хранилищу данных по адресу https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle

Объемы данных и частота обновления

  1. datasetgatkbestpractices : 542 ГБ
  2. datasetgatklegacybundles : 61 ГБ
  3. datasetgatktestdata: 2 ТБ
  4. datasetpublicbroadref: 477 ГБ
  5. datasetbroadpublic : 3 ТБ

Наборы данных обновляются ежемесячно в течение первой недели каждого месяца.

Место хранения

Этот набор данных хранится в регионах Azure "Западная часть США 2" и "Центрально-западная часть США". Для обеспечения приближенности рекомендуется выделять вычислительные ресурсы в регионе "Западная часть США 2" или "Центрально-западная часть США".

Доступ к данным

  1. datasetgatkbestpractices

    Западная часть США 2: https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset

    Центрально-западная часть США: https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset

  2. datasetgatklegacybundles

    Западная часть США 2: https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset

    Центрально-западная часть США: https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset

  3. datasetgatktestdata

    Западная часть США 2: https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset

    Центрально-западная часть США: https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset

  4. datasetpublicbroadref

    Западная часть США 2: https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset

    Центрально-западная часть США: https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset

    Южная центральная часть США: "https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset"

  5. datasetbroadpublic

    Западная часть США 2: https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset

    Центрально-западная часть США: https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset

    Южная центральная часть США: "https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset"

Условия использования

Посетите официальный веб-сайт, посвященный пакету ресурсов GATK.

Контакт

Посетите официальный веб-сайт, посвященный пакету ресурсов GATK.

Следующие шаги

Ознакомьтесь с другими наборами в каталоге Открытых наборов данных.