Ler e gravar arquivos XML
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Este artigo descreve como ler e gravar arquivos XML.
Extensible Markup Language (XML) é uma linguagem de marcação para formatação, armazenamento e compartilhamento de dados em formato textual. Ele define um conjunto de regras para serializar dados que variam de documentos a estruturas de dados arbitrárias.
O suporte nativo ao formato de arquivo XML permite a ingestão, consulta e análise de dados XML para processamento em lote ou streaming. Ele pode inferir e evoluir automaticamente esquemas e tipos de dados, suporta expressões SQL como from_xml
e pode gerar documentos XML. Ele não requer frascos externos e funciona perfeitamente com Auto Loader, read_files
e COPY INTO
. Opcionalmente, você pode validar cada registro XML de nível de linha em relação a uma definição de esquema XML (XSD).
Requisitos
Databricks Runtime 14.3 e superior
Analisar registros XML
A especificação XML exige uma estrutura bem formada. No entanto, essa especificação não é mapeada imediatamente para um formato tabular. Você deve especificar a rowTag
opção para indicar o elemento XML que mapeia para um DataFrame
Row
arquivo . O rowTag
elemento torna-se o nível struct
superior. Os elementos filho de rowTag
tornar-se os campos do nível struct
superior.
Você pode especificar o esquema para esse registro ou deixá-lo ser inferido automaticamente. Como o analisador examina apenas os elementos, o DTD e as rowTag
entidades externas são filtrados.
Os exemplos a seguir ilustram a inferência de esquema e a análise de um arquivo XML usando diferentes opções de rowTag
:
Python
xmlString = """
<books>
<book id="bk103">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Maeve Ascendant</title>
</book>
<book id="bk104">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Oberon's Legacy</title>
</book>
</books>"""
xmlPath = "dbfs:/tmp/books.xml"
dbutils.fs.put(xmlPath, xmlString, True)
Scala
val xmlString = """
<books>
<book id="bk103">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Maeve Ascendant</title>
</book>
<book id="bk104">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Oberon's Legacy</title>
</book>
</books>"""
val xmlPath = "dbfs:/tmp/books.xml"
dbutils.fs.put(xmlPath, xmlString)
Leia o arquivo XML com rowTag
opção como "livros":
Python
df = spark.read.option("rowTag", "books").format("xml").load(xmlPath)
df.printSchema()
df.show(truncate=False)
Scala
val df = spark.read.option("rowTag", "books").xml(xmlPath)
df.printSchema()
df.show(truncate=false)
Saída:
root
|-- book: array (nullable = true)
| |-- element: struct (containsNull = true)
| | |-- _id: string (nullable = true)
| | |-- author: string (nullable = true)
| | |-- title: string (nullable = true)
+------------------------------------------------------------------------------+
|book |
+------------------------------------------------------------------------------+
|[{bk103, Corets, Eva, Maeve Ascendant}, {bk104, Corets, Eva, Oberon's Legacy}]|
+------------------------------------------------------------------------------+
Leia o arquivo XML com rowTag
como "livro":
Python
df = spark.read.option("rowTag", "book").format("xml").load(xmlPath)
# Infers three top-level fields and parses `book` in separate rows:
Scala
val df = spark.read.option("rowTag", "book").xml(xmlPath)
// Infers three top-level fields and parses `book` in separate rows:
Saída:
root
|-- _id: string (nullable = true)
|-- author: string (nullable = true)
|-- title: string (nullable = true)
+-----+-----------+---------------+
|_id |author |title |
+-----+-----------+---------------+
|bk103|Corets, Eva|Maeve Ascendant|
|bk104|Corets, Eva|Oberon's Legacy|
+-----+-----------+---------------+
Opções de fonte de dados
As opções de fonte de dados para XML podem ser especificadas das seguintes maneiras:
- Os
.option/.options
seguintes métodos:- DataFrameReader
- DataFrameWriter
- DataStreamReader
- DataStreamWriter
- As seguintes funções integradas:
- A cláusula
OPTIONS
de CREATE TABLE USANDO DATA_SOURCE
Para uma lista de opções, consulte as opções do Carregador Automático .
Suporte a XSD
Opcionalmente, você pode validar cada registro XML de nível de linha por uma definição de esquema XML (XSD). O arquivo XSD é especificado na rowValidationXSDPath
opção. De outra forma, o XSD não afeta o esquema fornecido ou inferido. Um registro que falha na validação é marcado como "corrompido" e tratado com base na opção de modo de tratamento de registro corrompido descrita na seção de opções.
Você pode usar XSDToSchema
para extrair um esquema Spark DataFrame de um arquivo XSD. Ele suporta apenas tipos simples, complexos e de sequência, e suporta apenas a funcionalidade XSD básica.
import org.apache.spark.sql.execution.datasources.xml.XSDToSchema
import org.apache.hadoop.fs.Path
val xsdPath = "dbfs:/tmp/books.xsd"
val xsdString = """<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<xs:schema xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
<xs:element name="book">
<xs:complexType>
<xs:sequence>
<xs:element name="author" type="xs:string" />
<xs:element name="title" type="xs:string" />
<xs:element name="genre" type="xs:string" />
<xs:element name="price" type="xs:decimal" />
<xs:element name="publish_date" type="xs:date" />
<xs:element name="description" type="xs:string" />
</xs:sequence>
<xs:attribute name="id" type="xs:string" use="required" />
</xs:complexType>
</xs:element>
</xs:schema>"""
dbutils.fs.put(xsdPath, xsdString, true)
val schema1 = XSDToSchema.read(xsdString)
val schema2 = XSDToSchema.read(new Path(xsdPath))
A tabela a seguir mostra a conversão de tipos de dados XSD em tipos de dados do Spark:
Tipos de dados XSD | Tipos de dados do Spark |
---|---|
boolean |
BooleanType |
decimal |
DecimalType |
unsignedLong |
DecimalType(38, 0) |
double |
DoubleType |
float |
FloatType |
byte |
ByteType |
short , unsignedByte |
ShortType |
integer , negativeInteger , nonNegativeInteger , nonPositiveInteger , positiveInteger , unsignedShort |
IntegerType |
long , unsignedInt |
LongType |
date |
DateType |
dateTime |
TimestampType |
Others |
StringType |
Analisar XML aninhado
Os dados XML numa coluna do tipo cadeia de caracteres num DataFrame existente podem ser processados por schema_of_xml
e from_xml
que retornam o esquema e os resultados analisados como novas colunas struct
. Os dados XML passados como um argumento para schema_of_xml
e from_xml
devem ser um único registro XML bem formado.
schema_of_xml
Sintaxe
schema_of_xml(xmlStr [, options] )
Argumentos
-
xmlStr
: Uma expressão STRING especificando um único registro XML bem formado. -
options
: Um literal opcionalMAP<STRING,STRING>
especificando diretivas.
Devoluções
Uma STRING que contém uma definição de uma estrutura com n campos de texto onde os nomes das colunas são derivados dos elementos XML e atributos. Os valores de campo contêm os tipos SQL formatados derivados.
from_xml
Sintaxe
from_xml(xmlStr, schema [, options])
Argumentos
-
xmlStr
: Uma expressão STRING especificando um único registro XML bem formado. -
schema
: Uma expressão STRING ou invocação daschema_of_xml
função. -
options
: Um literal opcionalMAP<STRING,STRING>
especificando diretivas.
Devoluções
Uma estrutura com nomes de campo e tipos correspondentes à definição de esquema. O esquema deve ser definido como nome de coluna separado por vírgulas e pares de tipos de dados, conforme usado, por exemplo, em CREATE TABLE
. A maioria das opções mostradas nas opções da fonte de dados é aplicável com as seguintes exceções:
-
rowTag
: Como há apenas um registro XML, arowTag
opção não é aplicável. -
mode
(padrão:PERMISSIVE
): Permite um modo para lidar com registros corrompidos durante a análise.-
PERMISSIVE
: Quando ele encontra um registro corrompido, coloca a cadeia de caracteres malformada em um campo configurado porcolumnNameOfCorruptRecord
, e define campos malformados comonull
. Para manter registos corrompidos, pode-se definir um campo do tipo string chamadocolumnNameOfCorruptRecord
num esquema definido pelo utilizador. Se um esquema não tiver o campo, ele descartará registros corrompidos durante a análise. Ao inferir um esquema, ele adiciona implicitamente um campocolumnNameOfCorruptRecord
em um esquema de saída. -
FAILFAST
: Lança uma exceção quando ela atende a registros corrompidos.
-
Conversão de estruturas
Devido às diferenças de estrutura entre DataFrame e XML, existem algumas regras de conversão de dados XML de e DataFrame
para DataFrame
dados XML. Observe que a manipulação de atributos pode ser desabilitada com a opção excludeAttribute
.
Conversão de XML para DataFrame
Atributos: Os atributos são convertidos como campos com o prefixo attributePrefix
do título .
<one myOneAttrib="AAAA">
<two>two</two>
<three>three</three>
</one>
produz um esquema abaixo:
root
|-- _myOneAttrib: string (nullable = true)
|-- two: string (nullable = true)
|-- three: string (nullable = true)
Dados de caracteres em um elemento que contém atributo(s) ou elemento(s) filho(s): eles são analisados no valueTag
campo. Se houver várias ocorrências de dados de caracteres, o valueTag
campo será convertido em um array
tipo.
<one>
<two myTwoAttrib="BBBBB">two</two>
some value between elements
<three>three</three>
some other value between elements
</one>
produz um esquema abaixo:
root
|-- _VALUE: array (nullable = true)
| |-- element: string (containsNull = true)
|-- two: struct (nullable = true)
| |-- _VALUE: string (nullable = true)
| |-- _myTwoAttrib: string (nullable = true)
|-- three: string (nullable = true)
Conversão de DataFrame para XML
Elemento como uma matriz em uma matriz: Escrever um arquivo XML a partir de DataFrame
, onde um campo ArrayType
com seu elemento como ArrayType
teria um campo aninhado adicional para o elemento. Isso não aconteceria na leitura e gravação de dados XML, mas na escrita de uma DataFrame
leitura de outras fontes. Portanto, ida e volta na leitura e gravação de arquivos XML tem a mesma estrutura, mas escrever uma DataFrame
leitura de outras fontes é possível ter uma estrutura diferente.
DataFrame com um esquema abaixo:
|-- a: array (nullable = true)
| |-- element: array (containsNull = true)
| | |-- element: string (containsNull = true)
e com os dados abaixo:
+------------------------------------+
| a|
+------------------------------------+
|[WrappedArray(aa), WrappedArray(bb)]|
+------------------------------------+
produz um arquivo XML abaixo:
<a>
<item>aa</item>
</a>
<a>
<item>bb</item>
</a>
O nome do elemento da matriz sem nome no DataFrame
é especificado pela opção arrayElementName
(Padrão: item
).
Coluna de dados resgatados
Os dados resgatados na coluna garantem que nunca perca ou falhe em obter dados durante o ETL. Você pode habilitar a coluna de dados resgatados para capturar quaisquer dados que não foram analisados porque um ou mais campos em um registro têm um dos seguintes problemas:
- Ausente do esquema fornecido
- Não corresponde ao tipo de dados do esquema fornecido
- Tem uma incompatibilidade de maiúsculas e minúsculas com os nomes de campo no esquema fornecido
A coluna de dados resgatados é retornada como um documento JSON contendo as colunas que foram resgatadas e o caminho do arquivo de origem do registro. Para remover o caminho do arquivo de origem da coluna de dados resgatados, você pode definir a seguinte configuração SQL:
Python
spark.conf.set("spark.databricks.sql.rescuedDataColumn.filePath.enabled", "false")
Scala
spark.conf.set("spark.databricks.sql.rescuedDataColumn.filePath.enabled", "false").
Você pode habilitar a coluna de dados resgatados definindo a opção rescuedDataColumn
para um nome de coluna ao ler dados, como _rescued_data
com spark.read.option("rescuedDataColumn", "_rescued_data").format("xml").load(<path>)
.
O analisador XML suporta três modos ao analisar registros: PERMISSIVE
, DROPMALFORMED
e FAILFAST
. Quando usado em conjunto com rescuedDataColumn
o , as incompatibilidades de tipo de dados não fazem com que os registros sejam descartados no DROPMALFORMED
modo ou gerem um erro no FAILFAST
modo. Somente registros corrompidos (XML incompleto ou malformado) são descartados ou geram erros.
Inferência de esquema e evolução no Auto Loader
Para obter uma discussão detalhada deste tópico e das opções aplicáveis, consulte Configurar inferência e evolução de esquema no Auto Loader. Você pode configurar o Auto Loader para detetar automaticamente o esquema de dados XML carregados, permitindo inicializar tabelas sem declarar explicitamente o esquema de dados e evoluir o esquema de tabela à medida que novas colunas são introduzidas. Isso elimina a necessidade de rastrear e aplicar manualmente as alterações de esquema ao longo do tempo.
Por padrão, a inferência de esquema do Auto Loader procura evitar problemas de evolução do esquema devido a incompatibilidades de tipo. Para formatos que não codificam tipos de dados (JSON, CSV e XML), o Auto Loader infere todas as colunas como cadeias de caracteres, incluindo campos aninhados em arquivos XML. O Apache Spark DataFrameReader
usa um comportamento diferente para inferência de esquema, selecionando tipos de dados para colunas em fontes XML com base em dados de exemplo. Para habilitar esse comportamento com o Auto Loader, defina a opção cloudFiles.inferColumnTypes
como true
.
O Auto Loader deteta a adição de novas colunas à medida que processa os seus dados. Quando o Auto Loader deteta uma nova coluna, o fluxo para com um UnknownFieldException
. Antes de o fluxo lançar este erro, o Auto Loader executa a inferência de esquema no mais recente microlote de dados e atualiza o local do esquema com o esquema mais recente, adicionando novas colunas no final do esquema. Os tipos de dados das colunas existentes permanecem inalterados. Auto Loader suporta diferentes modos de para evolução de esquema, que você define na opção cloudFiles.schemaEvolutionMode
.
Você pode usar indicações de esquema para aplicar as informações de esquema que você conhece e espera em um esquema inferido. Quando você souber que uma coluna é de um tipo de dados específico, ou se quiser escolher um tipo de dados mais geral (por exemplo, um duplo em vez de um inteiro), poderá fornecer um número arbitrário de dicas para tipos de dados de coluna como uma cadeia de caracteres usando a sintaxe de especificação do esquema SQL. Quando a coluna de dados resgatados é ativada, os campos nomeados com um formato diferente do do esquema são carregados na coluna _rescued_data
. Você pode alterar esse comportamento definindo a opção readerCaseSensitive
como false
, caso em que o Auto Loader lê dados de forma que não diferencia maiúsculas de minúsculas.
Exemplos
Os exemplos nesta seção usam um arquivo XML disponível para download no repositório Apache Spark GitHub.
Ler e escrever XML
Python
df = (spark.read
.format('xml')
.options(rowTag='book')
.load(xmlPath)) # books.xml
selected_data = df.select("author", "_id")
(selected_data.write
.options(rowTag='book', rootTag='books')
.xml('newbooks.xml'))
Scala
val df = spark.read
.option("rowTag", "book")
.xml(xmlPath) // books.xml
val selectedData = df.select("author", "_id")
selectedData.write
.option("rootTag", "books")
.option("rowTag", "book")
.xml("newbooks.xml")
R
df <- loadDF("books.xml", source = "xml", rowTag = "book")
# In this case, `rootTag` is set to "ROWS" and `rowTag` is set to "ROW".
saveDF(df, "newbooks.xml", "xml", "overwrite")
Você pode especificar manualmente o esquema ao ler dados:
Python
from pyspark.sql.types import StructType, StructField, StringType, DoubleType
custom_schema = StructType([
StructField("_id", StringType(), True),
StructField("author", StringType(), True),
StructField("description", StringType(), True),
StructField("genre", StringType(), True),
StructField("price", DoubleType(), True),
StructField("publish_date", StringType(), True),
StructField("title", StringType(), True)
])
df = spark.read.options(rowTag='book').xml('books.xml', schema = customSchema)
selected_data = df.select("author", "_id")
selected_data.write.options(rowTag='book', rootTag='books').xml('newbooks.xml')
Scala
import org.apache.spark.sql.types.{StructType, StructField, StringType, DoubleType}
val customSchema = StructType(Array(
StructField("_id", StringType, nullable = true),
StructField("author", StringType, nullable = true),
StructField("description", StringType, nullable = true),
StructField("genre", StringType, nullable = true),
StructField("price", DoubleType, nullable = true),
StructField("publish_date", StringType, nullable = true),
StructField("title", StringType, nullable = true)))
val df = spark.read.option("rowTag", "book").schema(customSchema).xml(xmlPath) // books.xml
val selectedData = df.select("author", "_id")
selectedData.write.option("rootTag", "books").option("rowTag", "book").xml("newbooks.xml")
R
customSchema <- structType(
structField("_id", "string"),
structField("author", "string"),
structField("description", "string"),
structField("genre", "string"),
structField("price", "double"),
structField("publish_date", "string"),
structField("title", "string"))
df <- loadDF("books.xml", source = "xml", schema = customSchema, rowTag = "book")
# In this case, `rootTag` is set to "ROWS" and `rowTag` is set to "ROW".
saveDF(df, "newbooks.xml", "xml", "overwrite")
API de SQL
A fonte de dados XML pode inferir tipos de dados:
DROP TABLE IF EXISTS books;
CREATE TABLE books
USING XML
OPTIONS (path "books.xml", rowTag "book");
SELECT * FROM books;
Você também pode especificar nomes e tipos de colunas em DDL. Neste caso, o esquema não é inferido automaticamente.
DROP TABLE IF EXISTS books;
CREATE TABLE books (author string, description string, genre string, _id string,
price double, publish_date string, title string)
USING XML
OPTIONS (path "books.xml", rowTag "book");
Carregar XML usando COPY INTO
DROP TABLE IF EXISTS books;
CREATE TABLE IF NOT EXISTS books;
COPY INTO books
FROM "/FileStore/xmltestDir/input/books.xml"
FILEFORMAT = XML
FORMAT_OPTIONS ('mergeSchema' = 'true', 'rowTag' = 'book')
COPY_OPTIONS ('mergeSchema' = 'true');
Ler XML com validação de linha
Python
df = (spark.read
.format("xml")
.option("rowTag", "book")
.option("rowValidationXSDPath", xsdPath)
.load(inputPath))
df.printSchema()
Scala
val df = spark.read
.option("rowTag", "book")
.option("rowValidationXSDPath", xsdPath)
.xml(inputPath)
df.printSchema
Analisar XML aninhado (from_xml e schema_of_xml)
Python
from pyspark.sql.functions import from_xml, schema_of_xml, lit, col
xml_data = """
<book id="bk103">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Maeve Ascendant</title>
<genre>Fantasy</genre>
<price>5.95</price>
<publish_date>2000-11-17</publish_date>
</book>
"""
df = spark.createDataFrame([(8, xml_data)], ["number", "payload"])
schema = schema_of_xml(df.select("payload").limit(1).collect()[0][0])
parsed = df.withColumn("parsed", from_xml(col("payload"), schema))
parsed.printSchema()
parsed.show()
Scala
import org.apache.spark.sql.functions.{from_xml,schema_of_xml,lit}
val xmlData = """
<book id="bk103">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Maeve Ascendant</title>
<genre>Fantasy</genre>
<price>5.95</price>
<publish_date>2000-11-17</publish_date>
</book>""".stripMargin
val df = Seq((8, xmlData)).toDF("number", "payload")
val schema = schema_of_xml(xmlData)
val parsed = df.withColumn("parsed", from_xml($"payload", schema))
parsed.printSchema()
parsed.show()
from_xml e schema_of_xml com a API SQL
SELECT from_xml('
<book id="bk103">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Maeve Ascendant</title>
<genre>Fantasy</genre>
<price>5.95</price>
<publish_date>2000-11-17</publish_date>
</book>',
schema_of_xml('
<book id="bk103">
<author>Corets, Eva</author>
<title>Maeve Ascendant</title>
<genre>Fantasy</genre>
<price>5.95</price>
<publish_date>2000-11-17</publish_date>
</book>')
);
Carregar XML com o carregador automático
Python
query = (spark.readStream
.format("cloudFiles")
.option("cloudFiles.format", "xml")
.option("rowTag", "book")
.option("cloudFiles.inferColumnTypes", True)
.option("cloudFiles.schemaLocation", schemaPath)
.option("cloudFiles.schemaEvolutionMode", "rescue")
.load(inputPath)
.writeStream
.option("mergeSchema", "true")
.option("checkpointLocation", checkPointPath)
.trigger(availableNow=True)
.toTable("table_name")
)
Scala
val query = spark.readStream
.format("cloudFiles")
.option("cloudFiles.format", "xml")
.option("rowTag", "book")
.option("cloudFiles.inferColumnTypes", true)
.option("cloudFiles.schemaLocation", schemaPath)
.option("cloudFiles.schemaEvolutionMode", "rescue")
.load(inputPath)
.writeStream
.option("mergeSchema", "true")
.option("checkpointLocation", checkPointPath)
.trigger(Trigger.AvailableNow()
.toTable("table_name")
)