OpenCRAVAT: Kit de Ferramentas da Análise Classificada Personalizada e Aberta de Variantes

O OpenCRAVAT é um pacote do Python que realiza a interpretação de variantes genômicas, incluindo impacto, anotação e pontuação da variante. O OpenCRAVAT tem uma arquitetura modular com uma ampla variedade de módulos de análise e recursos de anotação que podem ser selecionados e instalados/executados com base nas necessidades de um determinado estudo.

Para obter mais informações sobre os dados, confira OpenCravat.

Observação

A Microsoft fornece o Azure Open Datasets no estado em que se encontra. A Microsoft não oferece garantias nem coberturas, expressas ou implícitas, em relação ao uso dos conjuntos de dados. Até o limite permitido pela legislação local, a Microsoft se exime de toda a obrigação por danos ou perdas, inclusive diretos, consequentes, especiais, indiretos, acidentais ou punitivos, resultantes do uso dos conjuntos de dados.

Esse conjunto de dados é fornecido de acordo com os termos originais com que a Microsoft recebeu os dados de origem. O conjunto de dados pode incluir dados originados da Microsoft.

Fonte de dados

Esse conjunto de dados é um espelho da loja em https://store.opencravat.org e https://run.opencravat.org

Volumes de dados e frequência de atualização

Esse conjunto de dados inclui 500 GB de dados e é atualizado diariamente.

Local de armazenamento

Este conjunto de dados está armazenado nas regiões do Azure Oeste dos EUA 2 e Centro-Oeste dos EUA. É recomendável alocar recursos de computação no Oeste dos EUA 2 ou no Centro-Oeste dos EUA por questão de afinidade.

Acesso aos Dados

Oeste dos EUA 2: “https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset”

Centro-Oeste dos EUA: “https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset”

Termos de uso

O OpenCRAVAT está disponível com uma licença do GPLv3. A maioria das fontes de dados é gratuita para uso não comercial. Para uso comercial, consulte os contatos institucionais para cada fonte de dados.

Contact

rkarchi1@jhmi.edu

Próximas etapas

Exiba o restante dos conjuntos de dados no catálogo do Open Datasets.