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Pacote de recursos GATK

  • Artigo

O pacote de recursos GATK é uma coleção de arquivos padrão para trabalhar com os dados de ressequenciamento humano com o GATK.

Observação

A Microsoft fornece o Azure Open Datasets no estado em que se encontra. A Microsoft não oferece garantias nem coberturas, expressas ou implícitas, em relação ao uso dos conjuntos de dados. Até o limite permitido pela legislação local, a Microsoft se exime de toda a obrigação por danos ou perdas, inclusive diretos, consequentes, especiais, indiretos, acidentais ou punitivos, resultantes do uso dos conjuntos de dados.

Esse conjunto de dados é fornecido de acordo com os termos originais com que a Microsoft recebeu os dados de origem. O conjunto de dados pode incluir dados originados da Microsoft.

Fonte de dados

Esse conjunto de dados é um espelho do armazenamento de dados em https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle

Volumes de dados e frequência de atualização

  1. datasetgatkbestpractices : 542 GB
  2. datasetgatklegacybundles : 61 GB
  3. datasetgatktestdata : 2 TB
  4. datasetpublicbroadref : 477 GB
  5. datasetbroadpublic : 3 TB

Os conjuntos de dados são atualizados mensalmente durante a primeira semana de cada mês.

Local de armazenamento

Este conjunto de dados está armazenado nas regiões do Azure Oeste dos EUA 2 e Centro-Oeste dos EUA. É recomendável alocar recursos de computação no Oeste dos EUA 2 ou no Centro-Oeste dos EUA por questão de afinidade.

Acesso aos Dados

  1. datasetgatkbestpractices

    Oeste dos EUA 2: "https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-Oeste dos EUA: “https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset”

  2. datasetgatklegacybundles

    Oeste dos EUA 2: "https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-Oeste dos EUA: “https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset”

  3. datasetgatktestdata

    Oeste dos EUA 2: "https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-Oeste dos EUA: “https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset”

  4. datasetpublicbroadref

    Oeste dos EUA 2: "https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-Oeste dos EUA: “https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset”

    Centro-Sul dos EUA: 'https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset'

  5. datasetbroadpublic

    Oeste dos EUA 2: "https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-Oeste dos EUA: “https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset”

    Centro-Sul dos EUA: 'https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset'

Termos de uso

Visite o site oficial do pacote de recursos GATK.

Contact

Visite o site oficial do pacote de recursos GATK.

Próximas etapas

Exiba o restante dos conjuntos de dados no catálogo do Open Datasets.