Udostępnij za pośrednictwem

OpenCravat: otwórz niestandardową analizę rankingowej zestawu narzędzi Variant Toolkit

  • Artykuł

OpenCRAVAT to pakiet języka Python, który wykonuje interpretację wariantu genomicznego, w tym wpływ wariantu, adnotację i ocenianie. OpenCRAVAT ma architekturę modułową z szeroką gamą modułów analitycznych i zasobów adnotacji, które można wybrać i zainstalować/uruchomić w zależności od potrzeb danego badania.

Aby uzyskać więcej informacji na temat danych, zobacz OpenCravat.

Uwaga

Firma Microsoft udostępnia zestawy danych Platformy Azure open na zasadzie "tak, jak to jest". Firma Microsoft nie udziela żadnych gwarancji, wyraźnych lub domniemanych, gwarancji ani warunków w odniesieniu do korzystania z zestawów danych. W zakresie dozwolonym zgodnie z prawem lokalnym firma Microsoft nie ponosi odpowiedzialności za wszelkie szkody lub straty, w tym bezpośrednie, wtórne, specjalne, pośrednie, przypadkowe lub karne wynikające z korzystania z zestawów danych.

Zestaw danych jest udostępniany zgodnie z pierwotnymi warunkami, na jakich firma Microsoft otrzymała dane źródłowe. Zestaw danych może zawierać dane pozyskane z firmy Microsoft.

Źródło danych

Ten zestaw danych jest odzwierciedleniem magazynu w witrynie https://store.opencravat.org i https://run.opencravat.org

Woluminy danych i częstotliwość aktualizacji

Ten zestaw danych zawiera 500 GB danych i jest aktualizowany codziennie.

Lokalizacja usługi Storage

Ten zestaw danych jest przechowywany w regionach świadczenia platformy Azure: Zachodnie stany USA 2 i Zachodnio-środkowe stany USA. Zalecamy przydzielanie zasobów obliczeniowych w regionie Zachodnie stany USA 2 lub Zachodnio-środkowe stany USA z uwagi na koligację.

Dostęp do danych

Zachodnie stany USA 2: "https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset"

Zachodnio-środkowe stany USA: "https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

Warunki użytkowania

Pakiet OpenCRAVAT jest dostępny z licencją GPLv3. Większość źródeł danych jest bezpłatna do użytku niekomercyjnego. W przypadku użytku komercyjnego skonsultuj się z instytucjonalnymi kontaktami dla każdego źródła danych.

Kontakt biznesowy

rkarchi1@jhmi.edu

Następne kroki

Wyświetl pozostałe zestawy danych w katalogu Open Datasets (Otwieranie zestawów danych).