Patologia cyfrowa korzystająca z usługi DICOM

Artykuł
05/21/2024

Cyfrowe obrazowanie w patologii umożliwia udostępnianie obrazów poza laboratorium, trenowanie modeli sztucznej inteligencji/uczenia maszynowego i przechowywanie cyfrowych slajdów mikroskopu.

Aby zapewnić te korzyści, wiele organizacji konwertuje cyfrowe slajdy KtoTo le Slide Imaging (WSI) na standardowy format DICOM®. Gdy obrazy są w formacie DICOM, można je przechowywać w dostępnych komercyjnie systemach PACS, gdzie można nimi zarządzać przy użyciu typowych narzędzi i procesów radiologii.

Usługa DICOM dla patologii cyfrowej

Usługa DICOM obsługuje unikatowe wymagania patologii cyfrowej, takie jak:

Skalowanie i wydajność wymagana do przekazania wystąpień DICOM patologii, które są wieloma gb rozmiaru.
Szybki dostęp do ramek, aby umożliwić przeglądarce internetowej przesuwanie i powiększanie obrazów patologii DICOM bezproblemowo bez opóźnień ani rozmycia.
Ekonomiczny sposób przechowywania obrazów długoterminowych po diagnozie na potrzeby archiwizacji i badań.

Digitalizacji

Mimo że standard DICOM obsługuje teraz obrazy całego slajdu (WSI), wiele skanerów pozyskiwania nie przechwytuje obrazów w formacie DICOM. Usługa DICOM obsługuje tylko obrazy w formacie DICOM, dlatego konwersja formatu jest wymagana dla WSI w innych formatach. Istnieje kilka rozwiązań komercyjnych i open source do przeprowadzania tych konwersji formatów.

Oto kilka przykładów narzędzi typu open source do tworzenia własnego konwertera:

WSIDicomizer

Storage

Każdy przekonwertowany system WSI powoduje serię DICOM z wieloma wystąpieniami.

Przekazywanie wsadowe

Biorąc pod uwagę większy rozmiar i liczbę wystąpień, które należy przekazać, zalecamy przekazanie wsadowe każdej serii lub partii przekonwertowanych WSI przy użyciu importu.

Przekazywanie strumieniowe

Jeśli chcesz przekazać każdy plik podczas konwersji, użyj w przykładzie żądania pojedynczej części STOW.

Wymagania wstępne

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

Przetestowaliśmy obsługę dziesiątek przekazywania GBs w ciągu kilku sekund.

Pobieranie

Osoby przeglądające pobierają kafelki przechowywane jako ramki w wystąpieniu DICOM. Każde wystąpienie DICOM może zawierać wiele ramek. Zalecamy używanie równoległej ramki GET z jedną częścią w celu uzyskania lepszej wydajności.

Wymagania wstępne

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

Przetestowaliśmy obsługę pobierania kafelka 60 Kb w około 60-70 ms od klienta.

Osoby przeglądające

Zalecamy używanie dowolnej przeglądarki WSI, którą można skonfigurować przy użyciu usługi DICOMWeb i uwierzytelniania OIDC.

Przykładowa przeglądarka open source:

Postępuj zgodnie z wytycznymi CORS, jeśli przeglądarka bezpośrednio wchodzi w interakcję z usługą DICOM.

Znajdowanie partnera niezależnego dostawcy oprogramowania

Skontaktuj się z dostawcami oprogramowania, aby skontaktować się dicom-support@microsoft.com z naszymi partnerskimi dostawcami oprogramowania, które zapewniają kompleksowe rozwiązania i pomoc techniczną.

Następne kroki

Wdrażanie usługi DICOM na platformie Azure

Używanie interfejsów API DICOMweb z usługą DICOM

Uwaga

DICOM® jest zastrzeżonym znakiem towarowym National Electrical Manufacturers Association for its Standards publikacji odnoszących się do cyfrowej komunikacji informacji medycznych.

Udostępnij za pośrednictwem