Doelen openen
Het Open Targets Platform is een gegevensresource om de systematische identificatie en prioriteitstelling van mogelijke therapeutische drugsdoelen te vergemakkelijken. Deze resource integreert openbaar beschikbare gegevenssets, met inbegrip van gegevenssets die worden gegenereerd door het Open Targets-consortium, voor het bouwen en beoordelen van doelziektekoppelingen, die helpen bij het identificeren en prioriteren van drugsdoelen. Daarnaast bevat het relevante annotatie-informatie over doelen, ziekten, fenotypes, drugs en hun belangrijkste relaties.
De Open Targets Genetics markeert variantgeoriënteerd statistisch bewijs om de prioriteit van kandidaat causale varianten op eigenschappengerelateerde loci en identificatie van potentiële drugdoelen mogelijk te maken. Het verzamelt en combineert genetische associaties die zijn verzameld uit gepubliceerde literatuur en nieuw afgeleide gegevens uit bronnen zoals UK Biobank en FinnGen. Daarnaast bevat het functionele genomics-informatie zoals chromatineconformatie en interacties, samen met kwantitatieve eigenschappen loci (eQTLs, pQTLs en sQTLs). Grootschalige pijplijnen passen statistische fijntoewijzing toe op duizenden eigenschappengerelateerde loci om associatiesignalen op te lossen en elke variant te koppelen aan de proximale en distale doelgenen met behulp van een 'Locus2Gene'-evaluatie. Geïntegreerde colokalisatieanalyses tussen eigenschappen en koppeling naar gedetailleerde farmaceutische verbindingen breiden de capaciteit van Open Targets Genetics uit om mogelijkheden voor het verplaatsen van geneesmiddelen en gedeelde genetische architectuur te verkennen.
- Voor meer informatie over Open Targets Platform bezoek - Open Targets Platform
- Ga naar Open Targets Genetics voor meer informatie over Open Targets Genetics - Open Targets Genetics
Notitie
Microsoft biedt Azure Open Datasets op basis van 'zoals is'. Microsoft geeft geen garanties, uitdrukkelijk of impliciet, garanties of voorwaarden met betrekking tot uw gebruik van de gegevenssets. Voor zover toegestaan volgens uw lokale wetgeving, wijst Microsoft alle aansprakelijkheid af voor eventuele schade of verliezen, waaronder directe, gevolgschade, speciale, indirecte, incidentele of strafbare gegevenssets, die het gevolg zijn van uw gebruik van de gegevenssets.
Deze gegevensset wordt geleverd onder de oorspronkelijke voorwaarden dat Microsoft de brongegevens heeft ontvangen. De gegevensset kan gegevens bevatten die afkomstig zijn van Microsoft.
Gegevensbron
Deze gegevensset is een spiegel van http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest en http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/
Gegevensvolumes en updatefrequentie
Deze gegevensset bevat ongeveer 350 GB aan gegevens en wordt dagelijks bijgewerkt.
Opslaglocatie
Deze gegevensset wordt opgeslagen in de Azure-regio VS - west 2. Het toewijzen van rekenresources in VS - west 2 wordt aanbevolen voor affiniteit.
Toegang tot gegevens
US - west 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset
Gebruiksrechtovereenkomst
Raadpleeg de gebruiksvoorwaarden voor gegevens, zoals hier wordt beschreven.
Contactpersoon
https://www.internationalgenome.org/contact
Bekijk de rest van de gegevenssets in de catalogus Open Datasets.