Digitale pathologie met behulp van de DICOM-service

Artikel
05/21/2024

Digitale imaging in pathologie biedt een manier om afbeeldingen buiten het lab te delen, AI/ML-modellen te trainen en gedigitaliseerde microscoopdia's op te slaan.

Om deze voordelen te realiseren, converteren veel organisaties digitale dia's Wie le Slide Imaging (WSI) naar dicom-standaardindeling®. Nadat de afbeeldingen de DICOM-indeling hebben, kunt u ze opslaan in commercieel beschikbare PACS-systemen, waar ze kunnen worden beheerd met behulp van veelgebruikte radiologiehulpprogramma's en -processen.

DICOM service voor digitale pathologie

De DICOM-service ondersteunt unieke vereisten voor digitale pathologie, zoals:

Schaal en prestaties die nodig zijn voor het uploaden van DICOM-exemplaren van pathologie die meerdere GB's groot zijn.
Snelle frametoegang zodat de webviewer DICOM-pathologieafbeeldingen soepel kan pannen en zoomen zonder vertraging of wazigheid.
Een rendabele manier om afbeeldingen lange termijn na diagnose op te slaan voor archivering en onderzoek.

Digitalisering

Hoewel de DICOM-standaard nu volledige dia-afbeeldingen (WSI) ondersteunt, leggen veel aanschafscanners geen afbeeldingen vast in de DICOM-indeling. De DICOM-service ondersteunt alleen afbeeldingen in de DICOM-indeling. Daarom is een indelingsconversie vereist voor WSI in andere indelingen. Er bestaan verschillende commerciële en opensource-oplossingen om deze indelingsconversies uit te voeren.

Hier volgen enkele voorbeelden van opensource-hulpprogramma's om uw eigen conversieprogramma te bouwen:

WSIDicomizer

Storage

Elke geconverteerde WSI resulteert in een DICOM-serie met meerdere exemplaren.

Batchupload

Gezien de grotere grootte en het aantal exemplaren dat moet worden geüpload, raden we aan batchupload van elke reeks of een batch geconverteerde WSI's met behulp van Import te gebruiken.

Uploaden via streaming

Als u elk bestand wilt uploaden terwijl het wordt geconverteerd, gebruikt u de aanvraag voor één deel STOW in het voorbeeld.

Vereisten

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

We hebben de ondersteuning van tientallen GB-uploads in enkele seconden getest.

Ophalen

Kijkers halen tegels op die zijn opgeslagen als frames in een DICOM-exemplaar. Elk DICOM-exemplaar kan meerdere frames bevatten. We raden u aan om parallel GET-frame met één onderdeel te gebruiken voor betere prestaties.

Vereisten

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

We hebben het downloaden van de tegel 60Kb getest in ongeveer 60-70 ms van de client.

Kijkers

U wordt aangeraden WSI Viewer te gebruiken die kan worden geconfigureerd met een DICOMWeb-service en OIDC-verificatie.

Voorbeeld van opensource-viewer:

Volg de CORS-richtlijnen als de Viewer rechtstreeks communiceert met de DICOM-service.

Een ISV-partner zoeken

Neem contact op dicom-support@microsoft.com met onze partner-ISV's die end-to-end oplossingen en ondersteuning bieden.

Volgende stappen

De DICOM-service implementeren in Azure

DICOMweb-API's gebruiken met de DICOM-service

Notitie

DICOM® is het gedeponeerde handelsmerk van de National Electrical Manufacturers Association voor haar standaardenpublicaties met betrekking tot digitale communicatie van medische informatie.

Delen via