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Open Targets

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Open Targets 플랫폼은 잠재적인 치료 약물 표적을 체계적으로 식별하고 우선 순위를 정할 수 있는 데이터 리소스입니다. 이 리소스는 Open Targets 컨소시엄에서 생성한 데이터 세트를 포함하여 공개적으로 사용 가능한 데이터 세트를 통합하여 표적-질병 연관성을 구축하고 점수를 매겨 약물 표적의 식별 및 우선 순위를 정하는 데 도움을 줍니다. 또한 표적, 질병, 표현형, 약물 및 이들의 주요 관계에 대한 관련 주석 정보를 통합합니다.

Open Targets Genetics는 변이 중심의 통계적 증거를 강조하여 형질 관련 유전자 자리에서 원인 변이 후보의 우선 순위를 정하고 잠재적인 약물 표적을 식별할 수 있도록 합니다. 공개된 문헌에서 수집한 유전적 연관성은 물론 영국 Biobank, FinnGen과 같은 소스에서 새롭게 도출한 데이터를 수집하고 결합합니다. 또한 염색질 형태 및 상호 작용과 같은 기능 유전체학 정보와 정량적 형질 유전자 자리(eQTL, pQTL, sQTL)도 포함됩니다. 대규모 파이프라인은 수천 개의 형질 관련 유전자 자리에 통계적 미세 매핑을 적용하여 연결 신호를 해독하고 'Locus2Gene' 평가를 사용하여 각 변이를 근위 및 원위 목표 유전자에 연결합니다. 통합된 교차 형질 코로케이션 분석과 세부 제약 화합물에 대한 연결은 약물 재창출 기회와 공유 유전자 아키텍처를 탐색할 수 있는 Open Targets Genetics의 역량을 확장합니다.

참고 항목

Microsoft는 Azure Open Datasets를 “있는 그대로” 제공합니다. Microsoft는 귀하의 데이터 세트 사용과 관련하여 어떠한 명시적이거나 묵시적인 보증, 보장 또는 조건을 제공하지 않습니다. 귀하가 거주하는 지역의 법규가 허용하는 범위 내에서 Microsoft는 귀하의 데이터 세트 사용으로 인해 발생하는 일체의 직접적, 결과적, 특별, 간접적, 부수적 또는 징벌적 손해 또는 손실을 비롯한 모든 손해 또는 손실에 대한 모든 책임을 부인합니다.

이 데이터 세트는 Microsoft가 원본 데이터를 받은 원래 사용 약관에 따라 제공됩니다. 데이터 세트에는 Microsoft가 제공한 데이터가 포함될 수 있습니다.

데이터 원본

이 데이터 세트는 http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest 및 http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/의 미러입니다.

데이터 볼륨 및 업데이트 빈도

이 데이터 세트는 약 350GB의 데이터를 포함하며 매일 업데이트됩니다.

스토리지 위치

이 데이터 세트는 미국 서부 2 Azure 지역에 저장됩니다. 선호도를 위해 미국 서부 2에서 컴퓨팅 리소스를 할당하는 것이 좋습니다.

데이터 액세스

미국 서부 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

사용 약관

여기에 설명된 대로 데이터 사용 약관을 참조하세요.

연락처

https://www.internationalgenome.org/contact

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