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Open Targets

  • [アーティクル]

Open Targets Platform は、潜在的な治療薬標的の体系的な識別と優先順位付けを容易にするデータ リソースです。 このリソースでは、公開されているデータセット (Open Targets コンソーシアムによって生成されたデータセットを含む) を統合して、標的と疾患の関連付けを構築およびスコア付けし、治療薬標的の識別と優先順位付けを支援します。 さらに、そこには、標的、疾患、表現型、薬剤、およびそれらの主な関係に関する適切な注釈情報が組み込まれています。

Open Targets Genetics では、Dバリアント中心の統計的証拠を浮き彫りにして、形質関連の遺伝子座における候補の原因バリアントの優先順位付けと、潜在的な薬剤標的の識別の両方を可能にします。 公開済みの文献から収集された遺伝子関連付けと、UK バイオバンクや FinnGen などのソースから新たに得られたデータを収集して結合します。 さらに、染色質構造や相互作用などの機能ゲノミクス情報と、量的な形質の遺伝子座 (eQTL、pQTL、sQTL) も含まれます。 大規模なパイプラインを使って、数千もの形質関連の遺伝子座に対して統計的なファイン マッピングを適用して、関連付け信号を解決し、"Locus2Gene" 評価を使用して各バリアントをその近接および末端の標的遺伝子にリンクします。 形質間の共局在化解析の統合、および詳細な医薬品化合物とのリンクによって、ドラッグ リポジショニングの機会と共有遺伝構成を探索する Open Targets Genetics の能力が拡張されます。

Note

Microsoft は、Azure Open Datasets を "現状有姿" で提供します。 Microsoft は、データセットの使用に関して、明示または黙示を問わず、いかなる保証も行わないものとし、条件を定めることもありません。 現地の法律の下で認められている範囲内で、Microsoft は、データセットの使用に起因する、直接的、派生的、特別、間接的、偶発的、または懲罰的なものを含めたいかなる損害または損失に対しても一切の責任を負わないものとします。

このデータセットは、Microsoft がソース データを受け取った元の条件に基づいて提供されます。 データセットには、Microsoft が提供するデータが含まれている場合があります。

データ ソース

このデータセットは、http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest および http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/ のミラーです

データ量と更新の頻度

このデータセットには、約 350 GB のデータが含まれており、毎日更新されます。

保存先

このデータセットは、米国西部 2 の Azure リージョンに保存されています。 アフィニティのために、米国西部 2 でコンピューティング リソースを割り当てることをお勧めします。

データ アクセス

米国西部 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

使用条件

こちらに記載されているデータ使用条件を参照してください。

お問い合わせ先

https://www.internationalgenome.org/contact

Open Datasets カタログの残りのデータセットについて確認します。