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DICOMサービスを用いたデジタル病理学

  • [アーティクル]

病理学のデジタル画像は、ラボ外で画像を共有し、AI/ML モデルをトレーニングし、デジタル化された顕微鏡スライドを格納する方法を提供します。

これらの利点を実現するために、多くの組織は、全スライド イメージング (WSI) デジタル スライドを DICOM® 標準形式に変換します。 画像が DICOM 形式になると、一般的な放射線学ツールとプロセスを使用して管理できる、市販の PACS システムに保存できます。

デジタル病理学のためのDICOMサービス

DICOMサービスは次のような独特なデジタル病理学の要件をサポートします:

  • サイズが複数の GB の病理 DICOM インスタンスをアップロードするために必要なスケールとパフォーマンス。
  • Webビューアーが遅延やぼやけずにDICOM病理画像をスムーズにパンおよびズームすることを可能にする高速フレームアクセス。
  • アーカイブおよび研究用の長期的なポスト診断の画像を保存するためのコスト効率の高い方法。

スライド全体のイメージングデジタル化とクラウド ストレージを示す図。

デジタル化

DICOM 標準では、スライド全体の画像 (WSI)がサポートされるようになりましたが、多くの取得スキャナーでは DICOM 形式で画像がキャプチャされません。 DICOM サービスは DICOM 形式のイメージのみをサポートするため、他の形式の WSI には形式変換が必要です。 これらの形式変換を実行するために、商用およびオープンソースのソリューションがいくつか存在します。

独自のコンバーターをビルドするためのオープン ソース ツールのサンプルを次に示します:

記憶域

変換された各 WSI は、複数のインスタンスを含む DICOM シリーズになります。

バッチ アップロード

アップロードする必要があるインスタンスのサイズと数が多い場合は、各シリーズのバッチ アップロード、または Import を使用して変換された WSI のバッチを使用することをお勧めします。

ストリーミング アップロード

変換時に各ファイルをアップロードする場合は、この例の中で、1 つの部分に対する 1 つの要求を使用します。

前提条件

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

数十 GB のアップロードを数秒でサポート するテストを行いました。

取得

ビューアーは、DICOM インスタンスにフレームとして保存されているタイルを取得します。 各 DICOM インスタンスには、複数のフレームを含めることができます。 パフォーマンスを向上させるには、並列単一パーツの GET フレームを使用することをお勧めします。

前提条件

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

クライアントから約 60 から 70 ミリ秒で 60 Kb タイルのダウンロードのサポートをテストしました。

閲覧者

DICOMWeb サービスと OIDC 認証で構成できる WSI ビューアーを使用することをお勧めします。

オープン ソース ビューアーのサンプル:

ビューアーが DICOM サービスと直接やり取りする場合は、CORS ガイドライン に従ってください。

ISV パートナーを探す

エンド ツー エンドのソリューションとサポートを提供するパートナー ISV と連携したい場合は、 dicom-support@microsoft.com にお問い合わせください。

次のステップ

AzureのDICOM サービスをデプロイする

DICOM サービスで DICOMweb API を使用する

Note

DICOM® は、医療情報のデジタル通信に関する標準出版物に関する米国電機工業会 (National Electrical Manufacturers Association) の登録商標です。