Panoramica di Trasformazioni OMOP nelle soluzioni per dati sanitari
L'obiettivo dell'implementazione di qualsiasi modello di dati comune è stabilire la standardizzazione e semplificare strutturazione, archiviazione, condivisione, scambio e utilizzo dei dati. Nelle soluzioni per dati sanitari, puoi utilizzare Trasformazioni OMOP per distribuire Common Data Model (CDM) OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) nell'ambiente del lakehouse Fabric. Questa distribuzione fornisce ai ricercatori della community OMOP accesso all'ampia scala di OneLake e alle funzionalità di intelligenza artificiale della piattaforma Fabric. La configurazione consente un'esecuzione efficiente e affidabile di analisi standardizzate per studi osservativi a livello di paziente e popolazione.
Distribuendo CDM OMOP in Fabric usando pipeline predefinite, puoi usare i notebook forniti per creare modelli statistici, condurre studi sulla distribuzione della popolazione e utilizzare report Power BI per confrontare visivamente vari interventi e i relativi effetti sui risultati dei pazienti. Queste funzionalità analitiche consentono ai ricercatori di eseguire analisi comparative, come la valutazione delle procedure e delle esposizioni ai farmaci o l'esame delle correlazioni tra le esposizioni ai farmaci e l'occorrenza delle condizioni. Per scopi di riferimento e informativi, la funzionalità fornisce anche notebook di esempio per questi scenari.
Trasformazioni OMOP è una funzionalità facoltativa delle soluzioni per dati sanitari in Microsoft Fabric. Hai la flessibilità di decidere se usarla o meno, a seconda di esigenze o scenari specifici.
Per informazioni su come distribuire, configurare e usare la funzionalità Trasformazioni OMOP, vedi:
- Distribuire e configurare Trasformazioni OMOP
- Usare le trasformazioni OMOP
- Usare i notebook di esempio di Trasformazioni OMOP
Dopo aver trasformato i dati nel modello OMOP, puoi anche eseguire query e analizzare i dati usando la funzionalità Individuazione e creazione di coorti (anteprima) nelle soluzioni per dati sanitari.
Elementi inclusi in CDM OMOP
Le soluzioni per dati sanitari in Microsoft Fabric implementano Common Data Model OMOP versione v5.4 con particolare attenzione sul mapping delle risorse cliniche FHIR alle tabelle OMOP corrispondenti in Fabric. Lo schema CDM OMOP completo con tutte le relative tabelle viene popolato nel lakehouse healthcare#_msft_gold_omop. Tuttavia, solo le tabelle cliniche sono mappate alle risorse FHIR.
Le tabelle in Economia sanitaria standardizzatanon rientrano nell'ambito e non sono mappate ad alcuna risorsa FHIR. Non verranno popolate dopo l'esecuzione delle pipeline di trasformazione dal lakehouse healthcare#_msft_silver al lakehouse healthcare#_msft_gold_omop.
Includiamo vocabolari standardizzati per mappare terminologie e codici dalle risorse cliniche FHIR a concetti standard OMOP corrispondenti nel dominio clinico.
Il set di dati Athena contiene riferimenti a vocabolari specifici del dominio.
I vocabolari standard inclusi nella versione corrente sono SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) e RxNorm.
