Compartir vía

Open Targets

  • Artículo

La plataforma Open targets es un recurso de datos para facilitar la identificación sistemática y la priorización de posibles objetivos terapéuticos. Este recurso integra conjuntos de datos disponibles públicamente, incluidos los conjuntos de datos que genera el consorcio Open Targets, para crear y puntuar asociaciones de enfermedades objetivo, ayudando en la identificación y priorización de los objetivos terapéuticos. Además, incorpora información de anotación pertinente sobre objetivos, enfermedades, fenotipos, medicamentos y sus relaciones clave.

Open Targets Genetics destaca la evidencia estadística centrada en variantes para permitir la priorización de variantes causales candidatas en puntos asociados a rasgos e identificación de posibles objetivos de medicamentos. Recopila y combina asociaciones genéticas recopiladas de la literatura publicada, así como datos recién derivados de fuentes como UK Biobank y FinnGen. Además, incluye información genómica funcional, como la conformación cromática y las interacciones, junto con puntos de rasgos cuantitativos (eQTL, pQTL y sQTL). Las canalizaciones a gran escala aplican una asignación estadística ajustada en miles de puntos asociados a rasgos para resolver señales de asociación y vincular cada variante a sus genes de destino proximales y distales mediante una evaluación de "Locus2Gene". Los análisis integrados de coubicación entre rasgos y la vinculación con compuestos farmacéuticos detallados amplían la capacidad de Open Targets Genetics para explorar las oportunidades de reposición de medicamentos y la arquitectura genética compartida.

Nota:

Microsoft proporciona Azure Open Datasets "tal cual". Microsoft no ofrece ninguna garantía, expresa o implícita, ni condición con respecto al uso que usted haga de los conjuntos de datos. En la medida en la que lo permita su legislación local, Microsoft declina toda responsabilidad por posibles daños o pérdidas, incluidos los daños directos, consecuenciales, especiales, indirectos, incidentales o punitivos, que resulten de su uso de los conjuntos de datos.

Este conjunto de datos se proporciona bajo los términos originales con los que Microsoft recibió los datos de origen. El conjunto de datos puede incluir datos procedentes de Microsoft.

Origen de datos

Este conjunto de datos es una réplica de http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest y http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/.

Volúmenes de datos y frecuencia de actualización

Este conjunto de datos contiene unos 350 GB de datos y se actualiza a diario.

Ubicación de almacenamiento

Este conjunto de datos se almacena en la región Oeste de EE. UU. 2 de Azure. Se recomienda asignar recursos informáticos en Oeste de EE. UU. 2 por afinidad.

Acceso a datos

Oeste de EE. UU. 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

Términos de uso

Consulta los términos de uso de datos tal como se describe aquí.

Contacto

https://www.internationalgenome.org/contact

Vea el resto de los conjuntos de datos en el catálogo de Open Datasets.