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OpenCravat: Open Custom Ranked Analysis of Variants Toolkit

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OpenCRAVAT es un paquete de Python que interpreta las variantes genómicas, incluidos el impacto, la anotación y la puntuación. OpenCRAVAT tiene una arquitectura modular con una amplia variedad de módulos de análisis y recursos de anotación que se pueden seleccionar e instalar o ejecutar en función de las necesidades de un estudio determinado.

Para obtener más información sobre los datos, consulte OpenCravat.

Nota

Microsoft proporciona Azure Open Datasets "tal cual". Microsoft no ofrece ninguna garantía, expresa o implícita, ni condición con respecto al uso que usted haga de los conjuntos de datos. En la medida en la que lo permita su legislación local, Microsoft declina toda responsabilidad por posibles daños o pérdidas, incluidos los daños directos, consecuenciales, especiales, indirectos, incidentales o punitivos, que resulten de su uso de los conjuntos de datos.

Este conjunto de datos se proporciona bajo los términos originales con los que Microsoft recibió los datos de origen. El conjunto de datos puede incluir datos procedentes de Microsoft.

Origen de datos

Este conjunto de datos es una representación del almacén en https://store.opencravat.org y https://run.opencravat.org.

Volúmenes de datos y frecuencia de actualización

Este conjunto de datos contiene 500 GB de datos y se actualiza a diario.

Ubicación de almacenamiento

Este conjunto de datos se almacena en las regiones Oeste de EE. UU. 2 y Centro-oeste de EE. UU. de Azure. Por afinidad, se recomienda asignar recursos de proceso de estas dos regiones.

Acceso a datos

Oeste de EE. UU. 2: "https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset"

Centro-oeste de EE. UU.: "https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

Términos de uso

OpenCRAVAT está disponible con una licencia GPLv3. La mayoría de los orígenes de datos son gratis para uso no comercial. Para uso comercial, consulte los contactos institucionales de cada origen de datos.

Contacto

rkarchi1@jhmi.edu

Pasos siguientes

Consulte el resto de los conjuntos de datos en el catálogo de Open Datasets.