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GATK Resource Bundle

  • Artículo

El lote de recursos de GATK es una colección de archivos estándar para trabajar con datos de resecuenciación humana con el kit GATK.

Nota

Microsoft proporciona Azure Open Datasets "tal cual". Microsoft no ofrece ninguna garantía, expresa o implícita, ni condición con respecto al uso que usted haga de los conjuntos de datos. En la medida en la que lo permita su legislación local, Microsoft declina toda responsabilidad por posibles daños o pérdidas, incluidos los daños directos, consecuenciales, especiales, indirectos, incidentales o punitivos, que resulten de su uso de los conjuntos de datos.

Este conjunto de datos se proporciona bajo los términos originales con los que Microsoft recibió los datos de origen. El conjunto de datos puede incluir datos procedentes de Microsoft.

Origen de datos

Este conjunto de datos es un reflejo del almacén de datos de https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle.

Volúmenes de datos y frecuencia de actualización

  1. datasetgatkbestpractices: 542 GB
  2. datasetgatklegacybundles: 61 GB
  3. datasetgatktestdata: 2 TB
  4. datasetpublicbroadref: 477 GB
  5. datasetbroadpublic: 3 TB

Los conjuntos de datos se actualizan mensualmente durante la primera semana de cada mes.

Ubicación de almacenamiento

Este conjunto de datos se almacena en las regiones Oeste de EE. UU. 2 y Centro-oeste de EE. UU. de Azure. Por afinidad, se recomienda asignar recursos de proceso de estas dos regiones.

Acceso a datos

  1. datasetgatkbestpractices

    Oeste de EE. UU. 2: "https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-oeste de EE. UU.: "https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

  2. datasetgatklegacybundles

    Oeste de EE. UU. 2: "https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-oeste de EE. UU.: "https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

  3. datasetgatktestdata

    Oeste de EE. UU. 2: "https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-oeste de EE. UU.: "https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

  4. datasetpublicbroadref

    Oeste de EE. UU. 2: "https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-oeste de EE. UU.: "https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-sur de EE. UU.: 'https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset'

  5. datasetbroadpublic

    Oeste de EE. UU. 2: "https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-oeste de EE. UU.: "https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

    Centro-sur de EE. UU.: 'https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset'

Términos de uso

Visite el sitio oficial del lote de recursos de GATK.

Contacto

Visite el sitio oficial del lote de recursos de GATK.

Pasos siguientes

Consulte el resto de los conjuntos de datos en el catálogo de Open Datasets.