Patología digital mediante el servicio DICOM

Artículo
05/21/2024

La creación de imágenes digitales en patología proporciona una manera de compartir imágenes fuera del laboratorio, entrenar modelos de IA/ML y almacenar diapositivas de microscopio digitalizada.

Para que estas ventajas se produzcan, muchas organizaciones convierten diapositivas digitales de Quién le Slide Imaging (WSI) al formato estándar DICOM®. Después de que las imágenes estén en formato DICOM, puede almacenarlas en sistemas PACS disponibles comercialmente donde se pueden administrar mediante herramientas y procesos de radiología comunes.

Servicio DICOM para la patología digital

El servicio DICOM admite requisitos únicos de patología digital como:

Escalado y rendimiento necesarios para cargar instancias DICOM patológicas con varios GB de tamaño.
Acceso rápido a fotogramas para permitir al visor web desplazar y acercar imágenes de patología DICOM sin problemas sin retrasos ni desenfoques.
Una manera rentable de almacenar imágenes a largo plazo después del diagnóstico para el uso de archivo e investigación.

Digitalización

Aunque el estándar DICOM ahora admite imágenes de diapositiva completa (WSI), muchos escáneres de adquisición no capturan imágenes en formato DICOM. El servicio DICOM solo admite imágenes en formato DICOM, por lo que se requiere una conversión de formato para WSI en otros formatos. Existen varias soluciones comerciales y de código abierto para realizar estas conversiones de formato.

Estos son algunos ejemplos código abierto herramientas para crear su propio convertidor:

WSIDicomizer

Storage

Cada WSI convertido da como resultado una serie DICOM con varias instancias.

Carga por lotes

Teniendo en cuenta el mayor tamaño y el número de instancias que deben cargarse, se recomienda cargar por lotes de cada serie o un lote de WSIs convertidos mediante Import.

Carga de streaming

Si desea cargar cada archivo a medida que se convierte, use la solicitud de elemento único STOW en el ejemplo.

Requisitos previos

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

Probamos la compatibilidad con decenas de cargas de GB en pocos segundos.

Recuperación

Los visores recuperan iconos almacenados como fotogramas en una instancia de DICOM. Cada instancia de DICOM puede contener varios fotogramas. Se recomienda usar el marco GET de una sola parte en paralelo para mejorar el rendimiento.

Requisitos previos

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

Probamos la descarga de mosaicos de 60 Kb en aproximadamente 60-70 ms del cliente.

Lectores

Se recomienda usar cualquier Visor WSI que se pueda configurar con un servicio DICOMWeb y la autenticación OIDC.

Visor de código abierto de ejemplo:

Siga las directrices de CORS si el Visor interactúa directamente con el servicio DICOM.

Búsqueda de un asociado de ISV

Póngase en dicom-support@microsoft.com contacto con si desea trabajar con nuestros ISV asociados que proporcionan soluciones y soporte técnico de un extremo a otro.

Pasos siguientes

Implementación del servicio DICOM en Azure

Uso de las API de DICOMweb con el servicio DICOM

Nota:

DICOM® es la marca registrada de la Asociación Nacional de Fabricantes Eléctricos para sus publicaciones de normas relacionadas con las comunicaciones digitales de información médica.

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