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Información general de las transformaciones OMOP en soluciones de datos de atención sanitaria

El objetivo de implementar cualquier modelo de datos común es establecer la estandarización y agilizar la estructuración, el almacenamiento, el uso compartido, el intercambio y el uso de los datos. En las soluciones de datos de atención sanitaria, puede usar transformaciones de OMOP para implementar el Common Data Model (CDM) de Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) en el entorno de almacén de lago de Fabric. Esta implementación proporciona a los investigadores de la comunidad de OMOP acceso a la escala expansiva de OneLake y a las capacidades de IA de la plataforma de Fabric. La configuración permite la ejecución eficiente y confiable de análisis estandarizados para estudios observacionales en el nivel de paciente y población.

Al implementar CDM OMOP en Fabric mediante canalizaciones prediseñadas, puede usar los cuadernos proporcionados para construir modelos estadísticos, realizar estudios de distribución de la población y utilizar informes de Power BI para comparar visualmente varias intervenciones y sus efectos en los resultados de los pacientes. Estas capacidades analíticas permiten a los investigadores realizar análisis comparativos, como la evaluación de procedimientos y exposiciones a medicamentos o el examen de correlaciones entre las exposiciones a medicamentos y los casos de afecciones. Como referencia y orientación, la capacidad también proporciona cuadernos de ejemplo para estos escenarios.

Las transformaciones de OMOP son una capacidad opcional bajo soluciones de datos de atención sanitaria en Microsoft Fabric. Tiene la flexibilidad de decidir si usarla o no, según sus necesidades o escenarios específicos.

Para aprender a implementar, configurar y usar la capacidad de transformaciones de OMOP, consulte:

Después de transformar sus datos en el modelo OMOP, también puede consultar y analizar los datos mediante la capacidad Descubrir y crear cohortes (versión preliminar) en soluciones de datos de atención sanitaria.

Qué incluye CDM de OMOP

Las soluciones de datos de atención sanitaria en Microsoft Fabric implementan Common Data Model de OMOP versión v5.4 y se centran en la asignación de Recursos Rápidos de Interoperabilidad en Salud (FHIR) a las tablas de OMOP correspondientes en Fabric. El esquema CDM de OMOP completo con todas sus tablas se rellena en el almacén de lago healthcare#_msft_gold_omop. Sin embargo, solo las tablas clínicas se asignan a los recursos de FHIR.

  • Las tablas de Economía de la salud estandarizada se encuentra fuera del ámbito y no están asignadas a ningún recurso de FHIR. No se rellenarán después de que se ejecuten las canalizaciones de transformación desde el almacén healthcare#_msft_silver al almacén de lago healthcare#_msft_gold_omop.

  • Incluimos Vocabularios estandarizados para asignar terminologías y códigos desde los recursos clínicos de FHIR a los conceptos estándar de OMOP correspondientes en el dominio clínico.

    El conjunto de datos de Athena contiene referencias a vocabularios específicos del dominio.

  • Los vocabularios estándar incluidos en la versión actual son SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) y RxNorm.

Imagen que muestra la representación del Common Data Model de OMOP.