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GATK-Ressourcenpaket

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Beim GATK-Ressourcenpaket handelt es sich um eine Sammlung von Standarddateien für die Arbeit mit menschlichen Resequenzierungsdaten mit dem GATK.

Hinweis

Microsoft stellt Datasets der Plattform Azure Open Datasets auf einer „As is“-Basis (d. h. ohne Mängelgewähr) zur Verfügung. Microsoft übernimmt weder ausdrücklich noch stillschweigend die Gewährleistung für Ihre Nutzung der Datasets und sichert keinerlei Garantien oder Bedingungen zu. Soweit nach örtlich anwendbarem Recht zulässig, lehnt Microsoft jegliche Haftung für Schäden oder Verluste ab. Dies schließt direkte, indirekte, besondere oder zufällige Schäden oder Verluste sowie Folge- und Strafschäden und damit verbundene Verluste ein, die sich aus Ihrer Nutzung der Datasets ergeben.

Für die Bereitstellung dieses Datasets gelten die ursprünglichen Nutzungsbedingungen, unter denen Microsoft die Quelldaten bezogen hat. Das Dataset kann Daten von Microsoft enthalten.

Datenquelle

Bei diesem Dataset handelt es sich um eine Spiegelung des Datenspeichers unter https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle.

Datenvolumes und Aktualisierungshäufigkeit

  1. datasetgatkbestpractices: 542 GB
  2. datasetgatklegacybundles: 61 GB
  3. datasetgatktestdata: 2 TB
  4. datasetpublicbroadref: 477 GB
  5. datasetbroadpublic: 3 TB

Datasets werden monatlich während der ersten Woche jedes Monats aktualisiert.

Speicherort

Dieses Dataset wird in den Azure-Regionen „USA, Westen 2“ und „USA, Westen-Mitte“ gespeichert. Aus Gründen der Affinität wird die Zuweisung von Computeressourcen in die Regionen „USA, Westen 2“ oder „USA, Westen-Mitte“ empfohlen.

Datenzugriff

  1. datasetgatkbestpractices

    USA, Westen 2: https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset

    USA, Westen-Mitte: ‚ https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset ‘

  2. datasetgatklegacybundles

    USA, Westen 2: https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset

    USA, Westen-Mitte: ‚ https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset ‘

  3. datasetgatktestdata

    USA, Westen 2: https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset

    USA, Westen-Mitte: ‚ https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset ‘

  4. datasetpublicbroadref

    USA, Westen 2: https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset

    USA, Westen-Mitte: ‚ https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset ‘

    USA, Süden-Mitte: 'https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset'

  5. datasetbroadpublic

    USA, Westen 2: https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset

    USA, Westen-Mitte: ‚ https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset ‘

    USA, Süden-Mitte: 'https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset'

Nutzungsbedingungen

Besuchen Sie die offizielle Website zum GATK-Ressourcenpaket.

Contact

Besuchen Sie die offizielle Website zum GATK-Ressourcenpaket.

Nächste Schritte

Machen Sie sich mit den restlichen Datasets im Open Datasets-Katalog vertraut.