Digitale Pathologie mit dem DICOM-Dienst

Artikel
05/21/2024

Digitale Bildgebung in der Pathologie bietet eine Möglichkeit, Bilder außerhalb des Labors zu teilen, AI/ML-Modelle zu trainieren und digitalisierte Mikroskopfolien zu speichern.

Um diese Vorteile zu erzielen, konvertieren viele Organisationen Wer le Slide Imaging (WSI) digitale Folien in das DICOM-Standardformat®. Nachdem sich die Bilder im DICOM-Format befinden, können Sie sie in kommerziell verfügbaren PACS-Systemen speichern, in denen sie mit gängigen Radiologie-Tools und -Prozessen verwaltet werden können.

DICOM Service für digitale Pathologie

Der DICOM-Service unterstützt einzigartige digitale Pathologie-Anforderungen wie:

Skalierung und Leistung, die zum Hochladen der Pathologie DICOM-Instanzen erforderlich sind, die mehrere GBs in Größe sind.
Schneller Framezugriff, um dem Web-Viewer das Verschieben und Zoomen von DICOM-Pathologiebildern ohne Verzögerungen oder Unschärfe zu ermöglichen.
Eine kostengünstige Möglichkeit, Bilder langfristig nach der Diagnose für die Archivierung und Forschung zu speichern.

Digitalisierung

Obwohl der DICOM-Standard jetzt ganze Folienbilder (WSI) unterstützt, erfassen viele Kaufscanner keine Bilder im DICOM-Format. Der DICOM-Dienst unterstützt nur Bilder im DICOM-Format, daher ist für WSI in anderen Formaten eine Formatkonvertierung erforderlich. Es gibt mehrere kommerzielle und Open-Source-Lösungen, um diese Formatkonvertierungen durchzuführen.

Hier sind einige Beispiele für Open Source-Tools zum Erstellen eines eigenen Konverters:

WSIDicomizer

Speicher

Jedes konvertierte WSI führt zu einer DICOM-Serie mit mehreren Instanzen.

Batchupload

In Anbetracht der größeren Größe und Anzahl von Instanzen, die hochgeladen werden müssen, empfehlen wir den Batchupload jeder Reihe oder eines Batches von konvertierten WSIs mit Import.

Streamingupload

Wenn Sie jede Datei so hochladen möchten, wie sie konvertiert wird, verwenden Sie die Einzelteilanforderung STOW im Beispiel.

Voraussetzungen

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

Wir haben die Unterstützung von Zehn-GBs-Uploads in wenigen Sekunden getestet.

Abrufen

Viewer rufen Kacheln ab, die als Frames in einer DICOM-Instanz gespeichert sind. Jede DICOM-Instanz kann mehrere Frames enthalten. Es wird empfohlen, paralleles GET-Frame für eine bessere Leistung zu verwenden.

Voraussetzungen

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

Wir haben das Herunterladen der Kachel mit 60 KB in ca. 60-70 ms vom Client getestet.

Besucher

Wir empfehlen die Verwendung eines WSI-Viewers, der mit einem DICOMWeb-Dienst und einer OIDC-Authentifizierung konfiguriert werden kann.

Beispiel für open-source-Viewer:

Befolgen Sie die CORS-Richtlinien , wenn der Viewer direkt mit dem DICOM-Dienst interagiert.

Suchen eines ISV-Partners

Wenden Sie sich an dicom-support@microsoft.com unsere Partner-ISVs, die End-to-End-Lösungen und Support bieten.

Nächste Schritte

Bereitstellen des DICOM-Diensts in Azure

Verwenden von DICOMweb-APIs mit dem DICOM-Dienst

Hinweis

DICOM® ist die eingetragene Marke des National Electrical Manufacturers Association für seine Standards-Publikationen über die digitale Kommunikation medizinischer Informationen.

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