Sdílet prostřednictvím

Otevřené cíle

  • Článek

Otevřená cílová platforma je datový zdroj, který usnadňuje systematickou identifikaci a stanovení priorit potenciálních léčebných cílů drog. Tento prostředek integruje veřejně dostupné datové sady, včetně datových sad generovaných konsorciem Open Targets, k vytváření a hodnocení přidružení cílových onemocnění, které pomáhají při identifikaci a stanovení priorit cílů drog. Kromě toho zahrnuje relevantní poznámkové informace o cílech, onemocněních, phenotypech, drogách a jejich klíčových vztazích.

Open Targets Genetics zvýrazňuje statistické důkazy zaměřené na varianty, které umožňují stanovení priorit kandidátských kauzálních variant při zrádce související s loku a identifikaci potenciálních cílů drog. Shromažďuje a kombinuje genetická sdružení shromážděná z publikované literatury a také nově odvozená data ze zdrojů, jako je UK Biobank a FinnGen. Kromě toho obsahuje informace o funkčních genomech, jako je shoda s chromatinem a interakce, spolu s kvantitativními lokalizačními lokacemi (eQTLs, pQTLs a sQTLs). Rozsáhlé kanály používají statistické jemné mapování napříč tisíci zrádcemi souvisejícími s loku k řešení asociačních signálů a propojení každé varianty s jeho proximálními a distalačními cílovými geny pomocí posouzení "Ogen2Gene". Integrované analýzy kolokalizace napříč vlastnostmi a propojení s podrobnými farmaceutiky rozšiřují kapacitu otevřených cílů Genetics, aby prozkoumaly příležitosti k přemístění léků a sdílenou genetickou architekturu.

Poznámka:

Microsoft poskytuje datové sady Azure Open Datasets na bázi "tak, jak je". Společnost Microsoft neposkytuje žádné záruky, výslovné ani předpokládané záruky ani podmínky týkající se vašeho používání datových sad. V rozsahu povoleném vaším místním zákonem společnost Microsoft odmítá veškerou odpovědnost za případné škody nebo ztráty, včetně přímých, následných, zvláštních, nepřímých, náhodných nebo represivních, vyplývajících z vašeho používání datových sad.

Na tuto datovou sadu se vztahují původní podmínky, které Microsoft přijal se zdrojovými daty. Datová sada může obsahovat data pocházející z Microsoftu.

Zdroj dat

Tato datová sada je zrcadlem http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest a http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/

Objemy dat a frekvence aktualizací

Tato datová sada obsahuje přibližně 350 GB dat a aktualizuje se každý den.

Dočasné úložiště

Tato datová sada je uložená v oblasti Azure USA – západ 2. Pro spřažení se doporučuje přidělení výpočetních prostředků v oblasti USA – západ 2.

Přístup k datům

USA – západ 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

Podmínky použití

Přečtěte si podmínky použití dat, jak je popsáno tady.

Kontakt

https://www.internationalgenome.org/contact

Prohlédněte si zbývající datové sady v katalogu Open Datasets.