Sdílet prostřednictvím

Databáze ImmuneCODE

  • Článek

Databáze ImmuneCODE™, která zahrnuje stovky milionů sekvencí T-cell Receptoru (TCR) z více než 1 400 subjektů vystavených nebo napadených virem SARS-CoV-2 a více než 160 000 vysoce důvěryhodných SARS-CoV-2 specifických TCR. Databáze je přístupná bez poplatků. Jejich data je možné analyzovat tak, aby pomohla globálním iniciativám, jejichž cílem je pochopit imunitní reakci na virus SARS-CoV-2 a vytvářet nové zásahy. Další informace o datové sadě najdete v přidružené publikaci.

Nejnovější dostupné datové sady ImmuneCODE obsahují: Release 002.

  • 1 486 subjektů vystavených nebo napadených virem SARSCoV-2: ImunitníCODE-Interprety-002.2.
  • Ukázková metadata: Imunitní kód-odsud-tags-002.2.tsv (572 kB) verze 002.2.
  • Vysoce spolehlivosti SARS-CoV-2 specifické (více než 160 000): ImmuneCODE-MIRA-Release 002.1.
  • Ukázková metadata: ImmuneCODE-Repertoire-Tags-002.2.xlsx (352 kB) verze 002.2.

Poznámka:

Microsoft poskytuje datové sady Azure Open Datasets na bázi "tak, jak je". Společnost Microsoft neposkytuje žádné záruky, výslovné ani předpokládané záruky ani podmínky týkající se vašeho používání datových sad. V rozsahu povoleném vaším místním zákonem společnost Microsoft odmítá veškerou odpovědnost za případné škody nebo ztráty, včetně přímých, následných, zvláštních, nepřímých, náhodných nebo represivních, vyplývajících z vašeho používání datových sad.

Na tuto datovou sadu se vztahují původní podmínky, které Microsoft přijal se zdrojovými daty. Datová sada může obsahovat data pocházející z Microsoftu.

Zdroj dat

Tato datová sada je zrcadlem https://clients.adaptivebiotech.com/pub/covid-2020.

Objemy dat a frekvence aktualizací

Tato datová sada obsahuje přibližně 228 GB dat a aktualizuje se každý den.

Dočasné úložiště

Tato datová sada je uložená v oblastech Azure USA – západ 2. Pro spřažení se doporučuje přidělení výpočetních prostředků v oblasti USA – západ 2.

Přístup k datům

USA – západ 2: 'https://dataset1000genomes.blob.core.windows.net/dataset'

USA – středozápad: 'https://dataset1000genomes-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

Podmínky použití

Další informace o podmínkách použití dat najdete v publikaci a podmínkách použití.

Kontakt

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7418738/

Další kroky

Prohlédněte si zbývající datové sady v katalogu Open Datasets.